More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2434 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  100 
 
 
575 aa  1172  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  51.72 
 
 
570 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  50.94 
 
 
583 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.09 
 
 
570 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  49.72 
 
 
587 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.47 
 
 
571 aa  525  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  49.45 
 
 
580 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  47.16 
 
 
583 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  46.97 
 
 
579 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  48.46 
 
 
579 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  46.61 
 
 
579 aa  516  1e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  47.34 
 
 
578 aa  518  1e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  47.13 
 
 
582 aa  516  1e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.65 
 
 
588 aa  516  1e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  46.95 
 
 
582 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  49.91 
 
 
570 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  47.36 
 
 
575 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  50.27 
 
 
578 aa  511  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  46.98 
 
 
582 aa  511  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  44.1 
 
 
577 aa  507  1e-142  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  45.65 
 
 
553 aa  505  1e-142  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  45.65 
 
 
553 aa  505  1e-142  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  45.62 
 
 
580 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  46.13 
 
 
576 aa  505  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  46.53 
 
 
575 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.1 
 
 
582 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  44.1 
 
 
582 aa  501  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.33 
 
 
582 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  46.14 
 
 
568 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  45.57 
 
 
614 aa  497  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  44.02 
 
 
580 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  46.36 
 
 
577 aa  493  1e-138  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  42.71 
 
 
578 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  49.73 
 
 
575 aa  489  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  43.6 
 
 
581 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  45.49 
 
 
548 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  42.91 
 
 
582 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  45.44 
 
 
552 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  45.88 
 
 
586 aa  482  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  44.4 
 
 
622 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  46.22 
 
 
587 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  1.28115e-11 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.06 
 
 
614 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  44.97 
 
 
595 aa  478  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  44.32 
 
 
580 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  42.93 
 
 
607 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  43.64 
 
 
578 aa  471  1e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  44.75 
 
 
583 aa  469  1e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  44.75 
 
 
583 aa  469  1e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  43.37 
 
 
624 aa  468  1e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  44.75 
 
 
583 aa  469  1e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  43.43 
 
 
614 aa  465  1e-130  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  42.61 
 
 
613 aa  466  1e-130  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  43.04 
 
 
600 aa  466  1e-130  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  44.57 
 
 
583 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  42.31 
 
 
613 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  43.25 
 
 
614 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  43.25 
 
 
614 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  43.25 
 
 
614 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.2 
 
 
584 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46698e-10 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  43.25 
 
 
614 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  44.2 
 
 
584 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  43.25 
 
 
614 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  42.65 
 
 
616 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  42.19 
 
 
621 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  44.2 
 
 
584 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  43.25 
 
 
614 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  44.2 
 
 
584 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  44.75 
 
 
583 aa  465  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  42.1 
 
 
615 aa  459  1e-128  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  42.29 
 
 
615 aa  461  1e-128  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.19 
 
 
621 aa  459  1e-128  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  44.79 
 
 
605 aa  462  1e-128  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  42.1 
 
 
615 aa  459  1e-128  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.78 
 
 
595 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  42.62 
 
 
614 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  42.29 
 
 
615 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  42.01 
 
 
615 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  42.11 
 
 
615 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.96 
 
 
595 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  43.27 
 
 
594 aa  453  1e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  42.81 
 
 
578 aa  452  1e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.06404e-05 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  43.27 
 
 
594 aa  453  1e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  43.27 
 
 
594 aa  454  1e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  43.27 
 
 
594 aa  453  1e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  42.81 
 
 
578 aa  455  1e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  43.27 
 
 
594 aa  453  1e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  43.27 
 
 
594 aa  453  1e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.94 
 
 
619 aa  453  1e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  43.27 
 
 
594 aa  453  1e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  43.27 
 
 
596 aa  453  1e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  41.22 
 
 
577 aa  450  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  42.36 
 
 
578 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  42.99 
 
 
578 aa  447  1e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  43.38 
 
 
582 aa  447  1e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  42.73 
 
 
630 aa  446  1e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  41.98 
 
 
631 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  42.16 
 
 
632 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  42.55 
 
 
618 aa  445  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  42.16 
 
 
632 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  42.16 
 
 
632 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>