More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2408 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  333  5e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  48.63 
 
 
172 aa  154  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  45.83 
 
 
172 aa  148  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  44.29 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  43.57 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  42.36 
 
 
182 aa  130  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  40.82 
 
 
155 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  40.82 
 
 
155 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  40.82 
 
 
155 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  40.82 
 
 
155 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  42.55 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  42.64 
 
 
173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  41.1 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  42.07 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  39.74 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  39.86 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  39.58 
 
 
155 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  39.58 
 
 
160 aa  124  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  40.94 
 
 
160 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  41.73 
 
 
171 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  45.9 
 
 
194 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  40 
 
 
172 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2293  thioredoxin family protein  43.2 
 
 
183 aa  121  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  37.34 
 
 
184 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  38.19 
 
 
173 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  37.5 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  44.92 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  38.02 
 
 
158 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  35.42 
 
 
168 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  37.41 
 
 
422 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  30.97 
 
 
167 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1612  redoxin domain-containing protein  36.31 
 
 
180 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  38.52 
 
 
182 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  37.7 
 
 
182 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  37.7 
 
 
178 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.52 
 
 
184 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.86 
 
 
168 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  31.54 
 
 
170 aa  95.5  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  37.5 
 
 
437 aa  95.5  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.1 
 
 
288 aa  94.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  32.26 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  27.56 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.09 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  29.73 
 
 
183 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  34.48 
 
 
173 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  34.48 
 
 
173 aa  91.7  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  32.09 
 
 
174 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.65 
 
 
228 aa  91.3  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1411  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.88 
 
 
180 aa  90.9  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  30.72 
 
 
173 aa  90.5  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5957  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.92 
 
 
378 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131947  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.72 
 
 
175 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.07 
 
 
446 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.72 
 
 
196 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  34.82 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.78 
 
 
393 aa  89  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.370556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.37 
 
 
189 aa  89  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  33.8 
 
 
433 aa  88.2  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
193 aa  87.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  32.76 
 
 
173 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.61 
 
 
169 aa  87  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1834  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.03 
 
 
381 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  33.62 
 
 
173 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1833  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.55 
 
 
360 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  35.14 
 
 
447 aa  86.3  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  32.76 
 
 
173 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.87 
 
 
280 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  31.9 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  32.76 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  32.76 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6578  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.82 
 
 
185 aa  85.5  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.861573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  35.94 
 
 
182 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  32.76 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2877  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.1 
 
 
376 aa  84.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  34.46 
 
 
183 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2803  putative thioredoxin  31.39 
 
 
172 aa  84  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482325  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  32.43 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  35.94 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  32.43 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2011  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.85 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  35.94 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  33.58 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7187  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.97 
 
 
375 aa  82.4  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2523  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.07 
 
 
369 aa  82  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.434668  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  33.59 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  29.37 
 
 
171 aa  82  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  34.59 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  34.82 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  34.59 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  31.06 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.88 
 
 
380 aa  80.9  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.03 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2789  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.27 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0340892 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  31.3 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  25.37 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1860  cytochrome c biogenesis protein, thiol-disulfide interchange protein  31.69 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  29.75 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  31.91 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>