64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2381 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  100 
 
 
175 aa  353  6e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  59.52 
 
 
187 aa  194  5e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  55.11 
 
 
179 aa  181  4e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  57.96 
 
 
176 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  57.32 
 
 
176 aa  178  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  57.32 
 
 
176 aa  177  5e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  57.79 
 
 
179 aa  175  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  56.96 
 
 
173 aa  173  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  56.96 
 
 
178 aa  170  8e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  55.13 
 
 
178 aa  165  3e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  47.43 
 
 
181 aa  164  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  57.62 
 
 
183 aa  164  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  45.4 
 
 
177 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  50 
 
 
176 aa  146  2e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  48 
 
 
177 aa  141  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  43.12 
 
 
184 aa  139  2e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  44.23 
 
 
176 aa  131  4e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  42.86 
 
 
177 aa  131  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  43.79 
 
 
177 aa  130  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  50 
 
 
185 aa  129  1e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  43.79 
 
 
176 aa  129  2e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  43.14 
 
 
176 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  41.71 
 
 
177 aa  128  4e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  40.48 
 
 
174 aa  124  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  43.75 
 
 
178 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  40.57 
 
 
183 aa  121  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  44.85 
 
 
176 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  36.16 
 
 
181 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  31.61 
 
 
177 aa  104  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  40 
 
 
168 aa  91.3  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  34.73 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  39.87 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  40.54 
 
 
161 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  37.68 
 
 
158 aa  85.9  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  40.15 
 
 
157 aa  80.1  2e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  36.69 
 
 
157 aa  77  1e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  33.54 
 
 
164 aa  75.1  5e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  74.3  8e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  34.75 
 
 
138 aa  68.9  3e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  34.75 
 
 
138 aa  68.9  3e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  32.82 
 
 
168 aa  65.9  3e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  32.41 
 
 
138 aa  65.5  4e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  32.41 
 
 
138 aa  65.5  4e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  36.19 
 
 
135 aa  65.1  5e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  33.8 
 
 
157 aa  64.3  9e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  31.72 
 
 
138 aa  63.5  1e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  31.72 
 
 
138 aa  63.9  1e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  31.72 
 
 
138 aa  63.5  1e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  31.72 
 
 
138 aa  63.5  1e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  31.72 
 
 
138 aa  63.5  1e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  31.72 
 
 
138 aa  63.5  1e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  32.17 
 
 
138 aa  62.8  2e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.6824e-06  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  33.09 
 
 
138 aa  59.7  2e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  28.06 
 
 
136 aa  58.2  5e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  29.37 
 
 
144 aa  57  1e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  28.37 
 
 
144 aa  56.2  2e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  23.29 
 
 
147 aa  55.8  3e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  28.17 
 
 
143 aa  51.6  5e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  26.35 
 
 
145 aa  51.6  5e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7414  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  50.1  2e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  27.46 
 
 
140 aa  48.1  5e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1096  Polyketide cyclase/dehydrase  27.05 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.446959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  25.85 
 
 
142 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0671  hypothetical protein  38.1 
 
 
151 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.361058  normal  0.889089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>