194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2298 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  100 
 
 		 219 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  74.65 
 
 		 226 aa  318  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  68.81 
 
 		 225 aa  313  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  74.77 
 
 		 225 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  74.77 
 
 		 225 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  70.7 
 
 		 228 aa  301  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  70.51 
 
 		 224 aa  300  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  68.72 
 
 		 217 aa  297  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  73 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  71.16 
 
 		 229 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  54.55 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  61.39 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  54.59 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  53.16 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  50.73 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  51.89 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  51.94 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  50.49 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.55 
 
 		 213 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.66 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  51.2 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.23 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.44 
 
 		 214 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  44.39 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.64 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.87 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.97 
 
 		 541 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  48.92 
 
 		 211 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.7 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  47.78 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  42.08 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.59 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  40.91 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  41.53 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.8 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  41.08 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.5 
 
 		 205 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  41.21 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.5 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  40.44 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.54 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.2 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  36.87 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  36.87 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  39.51 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  37.56 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.7 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  43.84 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  37.16 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  35.15 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  36.41 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  37.76 
 
 		 534 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.71 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  39.7 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  40.2 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  41.09 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  40.7 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  38.76 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  35.65 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  39.8 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  39.7 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  40.39 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  40.39 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  38.24 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1469  precorrin-8X methylmutase  41.71 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  39.39 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  41.21 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  38.12 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1519  precorrin-8X methylmutase  41.71 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  39 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37 
 
 		 520 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.86 
 
 		 451 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  38.69 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  39 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.15 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  38.19 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  38.73 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.24 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  42.71 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.46 
 
 		 469 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  37.08 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  33 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  38.54 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  41.95 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0340  precorrin-8X methylmutase  39.7 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  37.69 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  37.69 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  40.21 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  41.71 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  40.96 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  41.05 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  34.72 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  38.83 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  40.84 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  37.69 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0630  precorrin-8X methylmutase  38.51 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.872392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  39.68 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  38.16 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  38.5 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3745  precorrin-8X methylmutase  35.68 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.106474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>