114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2162 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2162  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  76.22 
 
 
189 aa  293  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1143  hypothetical protein  53.11 
 
 
189 aa  191  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0991  hypothetical protein  48.37 
 
 
195 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0351934  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5899  hypothetical protein  44.15 
 
 
197 aa  151  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  29.03 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  27.81 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  29.81 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  30.25 
 
 
180 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  28.49 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  30.86 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  28.95 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  27.33 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  22.95 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  26.92 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  30.43 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  30.94 
 
 
257 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  26.02 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  32.24 
 
 
253 aa  62.4  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  25.91 
 
 
191 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  29.35 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  26.14 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0174  hypothetical protein  30.43 
 
 
197 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  25 
 
 
191 aa  58.9  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  31.85 
 
 
213 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  25.38 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4506  protein of unknown function DUF820  29.37 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  26.98 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  30.91 
 
 
190 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3926  hypothetical protein  29.51 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746975  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  30.2 
 
 
214 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  36.78 
 
 
195 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  30.95 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  28.09 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3923  protein of unknown function DUF820  26.49 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  25.43 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  28.26 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  28.37 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3655  protein of unknown function DUF820  26.42 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  29.27 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  21.86 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  25.87 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4400  protein of unknown function DUF820  28.24 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  24.31 
 
 
191 aa  52  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5110  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
145 aa  52  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10814  normal  0.277047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  26.74 
 
 
193 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  26.04 
 
 
218 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  26.88 
 
 
189 aa  51.6  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  30.28 
 
 
201 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0998  hypothetical protein  24.52 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0239622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  49.06 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  26.95 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  26.74 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  32.41 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  31.78 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2879  protein of unknown function DUF820  26.79 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4303  protein of unknown function DUF820  24.65 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  25.38 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5076  protein of unknown function DUF820  26.12 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367196 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3150  protein of unknown function DUF820  23.72 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000141566  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3217  protein of unknown function DUF820  26.79 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  35.29 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  30.95 
 
 
207 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  50 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5178  protein of unknown function DUF820  27.22 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  38.98 
 
 
200 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3611  protein of unknown function DUF820  26.8 
 
 
187 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  0.983431 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0705  protein of unknown function DUF820  24.65 
 
 
188 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  43.33 
 
 
201 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4389  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 
186 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0820  protein of unknown function DUF820  25.43 
 
 
192 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0980811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0734  protein of unknown function DUF820  24.65 
 
 
188 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4452  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 
186 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal  0.551953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  32.41 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  22.16 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0761  hypothetical protein  27.27 
 
 
189 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal  0.591699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  30.08 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  26.45 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1238  protein of unknown function DUF820  28.46 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  23.63 
 
 
245 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  30.95 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1051  protein of unknown function DUF820  27.59 
 
 
189 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0285636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  36.78 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  39.62 
 
 
195 aa  45.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1268  protein of unknown function DUF820  41.51 
 
 
193 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  hitchhiker  0.00936719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0594  protein of unknown function DUF820  27.07 
 
 
191 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0819  protein of unknown function DUF820  25.83 
 
 
190 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0957178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0609  protein of unknown function DUF820  27.07 
 
 
191 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.214979  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  40.43 
 
 
198 aa  44.7  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  33.68 
 
 
227 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  29.23 
 
 
197 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  36.78 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  28.89 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  26.49 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  29.63 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  32.94 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0002  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  32.14 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  32.14 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>