More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2154 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  100 
 
 		 453 aa  904    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  31.81 
 
 		 498 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  29.74 
 
 		 523 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  32.04 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  28.85 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  28.85 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  27.9 
 
 		 443 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  27.85 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  26.39 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  27.83 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  26.85 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  27.67 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  25.84 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  27.8 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  29.91 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  27.7 
 
 		 441 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 515 aa  100  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  26.71 
 
 		 424 aa  99.8  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  26.78 
 
 		 449 aa  99.8  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 		 972 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 443 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  26.28 
 
 		 731 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  27.64 
 
 		 441 aa  97.8  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  26.23 
 
 		 447 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  25.27 
 
 		 454 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  26.68 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 447 aa  93.2  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  25.05 
 
 		 458 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 441 aa  90.1  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  27.13 
 
 		 457 aa  89.7  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  29.65 
 
 		 497 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  28.02 
 
 		 436 aa  87.4  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 565 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  26.29 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.81 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  26.28 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.52 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.32 
 
 		 576 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 627 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  24.01 
 
 		 594 aa  79.7  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.11 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.47 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  21.91 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.11 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  20.54 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.12 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.52 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.01 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  21.86 
 
 		 569 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.23 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.77 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.22 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.22 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  21.68 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.06 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.18 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 528 aa  73.6  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.5 
 
 		 480 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.49 
 
 		 464 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  25.79 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.84 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.95 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.1 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  20.47 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 635 aa  70.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.34 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>