More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2132 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  100 
 
 
360 aa  706  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.36 
 
 
388 aa  221  2e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  38.41 
 
 
340 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.02 
 
 
351 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  35.63 
 
 
434 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.04 
 
 
362 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  36.84 
 
 
365 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  37.15 
 
 
374 aa  203  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  36.13 
 
 
390 aa  201  1e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  37.11 
 
 
467 aa  197  2e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  35.49 
 
 
380 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  37.26 
 
 
349 aa  195  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  36.42 
 
 
415 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1969  RND family efflux transporter MFP subunit  39.42 
 
 
418 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.728278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  36.79 
 
 
353 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  35.67 
 
 
366 aa  186  7e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  36.25 
 
 
397 aa  184  2e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  35.17 
 
 
361 aa  183  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  34.83 
 
 
397 aa  182  9e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.22 
 
 
363 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  1.5248e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.22 
 
 
363 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  37.22 
 
 
381 aa  180  3e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  35.62 
 
 
348 aa  179  6e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.62 
 
 
397 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.39 
 
 
380 aa  179  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  34.38 
 
 
397 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  32.52 
 
 
360 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  32.52 
 
 
360 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  7.07575e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.64 
 
 
390 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.95 
 
 
383 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  34.26 
 
 
366 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7712  RND family efflux transporter MFP subunit  34.74 
 
 
383 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.59 
 
 
355 aa  176  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  35.64 
 
 
383 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  38.98 
 
 
376 aa  175  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  32.72 
 
 
360 aa  175  1e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  1.41161e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.22 
 
 
360 aa  174  1e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.36323e-06  hitchhiker  1.1193e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  32.72 
 
 
360 aa  175  1e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  32.22 
 
 
360 aa  174  1e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
362 aa  174  3e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  32.72 
 
 
360 aa  174  3e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  31.95 
 
 
361 aa  174  3e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  33.44 
 
 
360 aa  173  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  33.63 
 
 
382 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  33.63 
 
 
406 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  32.21 
 
 
357 aa  173  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  35.38 
 
 
381 aa  172  6e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  33.93 
 
 
382 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  33.87 
 
 
372 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
394 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
357 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  31.71 
 
 
385 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.32808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  31.42 
 
 
360 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.90652e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  33.76 
 
 
371 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  33.96 
 
 
365 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.53 
 
 
375 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  33.98 
 
 
417 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  33.12 
 
 
354 aa  169  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  32.84 
 
 
365 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  34.53 
 
 
376 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2846  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  33.43 
 
 
396 aa  167  3e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 
373 aa  166  7e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  36.52 
 
 
354 aa  165  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 
365 aa  165  1e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 
365 aa  165  1e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  32.78 
 
 
376 aa  165  1e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 
365 aa  164  2e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 
365 aa  164  2e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  33.77 
 
 
392 aa  164  2e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 
365 aa  164  2e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 
365 aa  164  2e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3371  secretion protein HlyD  35.37 
 
 
370 aa  164  2e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165029  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 
365 aa  164  2e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  32.9 
 
 
360 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  28.78 
 
 
360 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  5.42821e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  32.96 
 
 
366 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  3.31728e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  29.87 
 
 
351 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  31.83 
 
 
376 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 
351 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  32.92 
 
 
382 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  31.5 
 
 
367 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5137  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.55 
 
 
367 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.75 
 
 
372 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  35.29 
 
 
364 aa  159  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  33.66 
 
 
358 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  32.8 
 
 
352 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.66929e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.39 
 
 
371 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  31.83 
 
 
361 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  2.48395e-06  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.46 
 
 
353 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 
372 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.99 
 
 
369 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.18856e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 
369 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.21535e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  31.83 
 
 
403 aa  156  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.83 
 
 
370 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 
369 aa  156  5e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  9.84298e-06  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.42 
 
 
370 aa  156  5e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  29.78 
 
 
372 aa  156  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 
369 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.22351e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 
376 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  31.06 
 
 
403 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>