More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2121 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
254 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  59.45 
 
 
254 aa  320  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  59.29 
 
 
257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  59.92 
 
 
256 aa  311  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  62.06 
 
 
256 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  62.06 
 
 
256 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  62.06 
 
 
256 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  62.06 
 
 
256 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  62.06 
 
 
256 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  62.06 
 
 
256 aa  308  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  60.32 
 
 
258 aa  308  5e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  61.66 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  61.66 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  61.66 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  61.66 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  60.32 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  61.66 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  61.66 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  61.66 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  61.66 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  57.54 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  60.08 
 
 
256 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  57.14 
 
 
256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  58.89 
 
 
256 aa  300  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  58.89 
 
 
256 aa  299  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  58.89 
 
 
256 aa  299  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  61.66 
 
 
256 aa  299  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  58.17 
 
 
257 aa  299  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  59.6 
 
 
257 aa  299  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  59.68 
 
 
256 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  59.68 
 
 
256 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1779  ABC-2 type transporter  57.37 
 
 
275 aa  298  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  59.68 
 
 
256 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  56.4 
 
 
257 aa  298  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  59.68 
 
 
256 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  58.17 
 
 
271 aa  298  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  57.43 
 
 
262 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  58.73 
 
 
258 aa  297  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  59.68 
 
 
256 aa  297  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  58.89 
 
 
256 aa  296  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  57.03 
 
 
262 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  58.33 
 
 
256 aa  295  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  57.94 
 
 
256 aa  296  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  58.73 
 
 
258 aa  295  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  58.33 
 
 
256 aa  295  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  58.89 
 
 
258 aa  295  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  58.33 
 
 
256 aa  294  8e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  57.54 
 
 
256 aa  294  8e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  57.94 
 
 
256 aa  294  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  57.94 
 
 
256 aa  294  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  57.54 
 
 
262 aa  294  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  55.6 
 
 
257 aa  292  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  57.14 
 
 
259 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  58.8 
 
 
259 aa  291  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  57.14 
 
 
259 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  56.57 
 
 
263 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  57.26 
 
 
257 aa  289  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  56.8 
 
 
263 aa  289  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  56.86 
 
 
260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3928  ABC-2 type transporter  58 
 
 
256 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  57.03 
 
 
259 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  56.63 
 
 
259 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1984  ABC-2 type transporter  56.97 
 
 
260 aa  285  7e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0219123  normal  0.0104118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  57.43 
 
 
264 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  56.75 
 
 
259 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  54.8 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  56.8 
 
 
259 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  56.35 
 
 
259 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2614  ABC transporter, integral membrane protein  58.33 
 
 
256 aa  279  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  56.4 
 
 
271 aa  276  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  56.02 
 
 
276 aa  271  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1157  ABC-2 type transporter  58.33 
 
 
256 aa  270  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0839963  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  55.14 
 
 
259 aa  268  7e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  55.14 
 
 
259 aa  268  8e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  52.61 
 
 
257 aa  263  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  51.81 
 
 
257 aa  260  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2826  ABC-2 type transporter  57.54 
 
 
256 aa  255  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525501  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  48.8 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  48.8 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  48.19 
 
 
257 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  48.19 
 
 
257 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  45.71 
 
 
264 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0800  ABC-2 type transporter  43.08 
 
 
257 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0251444  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  44.18 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1453  ABC-2 type transporter  40.25 
 
 
253 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  43.78 
 
 
253 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  43.78 
 
 
253 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3270  ABC-2 type transporter  40.66 
 
 
253 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0898  ABC-2 type transporter  45.66 
 
 
253 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  40.8 
 
 
253 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  42.11 
 
 
255 aa  188  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  37.9 
 
 
255 aa  188  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 
253 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 
256 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  37.75 
 
 
253 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  37.9 
 
 
253 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  37.9 
 
 
253 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  37.9 
 
 
253 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.75 
 
 
253 aa  184  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  40.93 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>