More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1996 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  100 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  58.1 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  54.85 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  54.68 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  52.4 
 
 		 219 aa  205  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  55.4 
 
 		 217 aa  204  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  55.34 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  55.22 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  52.33 
 
 		 203 aa  203  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  53.2 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  55.17 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  51.23 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  50.98 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  53.62 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  49.5 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  52.22 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  53.17 
 
 		 210 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  51.5 
 
 		 200 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 208 aa  192  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  51.72 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 205 aa  191  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  51.72 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  50 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  51.23 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  48.31 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  45.54 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  59.34 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  47.5 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 225 aa  178  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  51.06 
 
 		 205 aa  177  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  48.22 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  48.19 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  47.72 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  49.2 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  48.56 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  48.26 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  47.32 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  45.1 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  45.45 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.29 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  47.57 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  50.79 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  46.8 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  48.15 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  40.87 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  40.87 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  50 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  48.77 
 
 		 244 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  49.47 
 
 		 210 aa  161  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  46.43 
 
 		 217 aa  161  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  43.94 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  46.43 
 
 		 217 aa  161  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  45.45 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  44.71 
 
 		 703 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  46.83 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  44.29 
 
 		 705 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  43.19 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  43.94 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  49.73 
 
 		 688 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  47.03 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  47.96 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  49.48 
 
 		 240 aa  157  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  45.19 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  43 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  44.17 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  48.78 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  49.21 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  44.13 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  46.43 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  47.21 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.39 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  44.21 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  46.57 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>