More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1978 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
432 aa  873  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  65.12 
 
 
430 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  63.43 
 
 
432 aa  583  1e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  64.19 
 
 
430 aa  581  1e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  64.42 
 
 
430 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  63.95 
 
 
430 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  65.27 
 
 
431 aa  579  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  64.42 
 
 
430 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  64.42 
 
 
430 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  65.58 
 
 
431 aa  580  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  65.27 
 
 
430 aa  579  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  64.19 
 
 
429 aa  577  1e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  63.49 
 
 
430 aa  575  1e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  64.27 
 
 
431 aa  577  1e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  63.66 
 
 
432 aa  574  1e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  4.72279e-08 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  63.43 
 
 
432 aa  576  1e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  64.12 
 
 
432 aa  577  1e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  63.66 
 
 
432 aa  575  1e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  63.43 
 
 
432 aa  571  1e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  63.43 
 
 
432 aa  571  1e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  1.95768e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  63.43 
 
 
432 aa  571  1e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  63.43 
 
 
432 aa  571  1e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  63.43 
 
 
432 aa  571  1e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  64.57 
 
 
431 aa  572  1e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  63.43 
 
 
432 aa  571  1e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.378806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  63.43 
 
 
432 aa  571  1e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  63.43 
 
 
432 aa  571  1e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  63.43 
 
 
432 aa  571  1e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  63.17 
 
 
430 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  63.19 
 
 
432 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  63.19 
 
 
432 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  62.96 
 
 
432 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  62.88 
 
 
432 aa  569  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.206e-11 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  62.94 
 
 
430 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  62.96 
 
 
432 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  62.96 
 
 
432 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  63.89 
 
 
432 aa  570  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  63.95 
 
 
431 aa  564  1e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  62.73 
 
 
432 aa  562  1e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  62.47 
 
 
431 aa  563  1e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  62.79 
 
 
432 aa  561  1e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  61.81 
 
 
432 aa  561  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  62.18 
 
 
432 aa  559  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  62.7 
 
 
431 aa  560  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  61.81 
 
 
432 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  61.81 
 
 
432 aa  561  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  62.79 
 
 
430 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  61.95 
 
 
431 aa  555  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.97035e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  62.56 
 
 
431 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  60.7 
 
 
432 aa  557  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  61.72 
 
 
431 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.76094e-06  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  62.27 
 
 
432 aa  557  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.34883e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  61.48 
 
 
431 aa  551  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  3.17238e-05  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  61.24 
 
 
438 aa  551  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  61.86 
 
 
431 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  62.09 
 
 
431 aa  553  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.03533e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  61.48 
 
 
431 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.82785e-07  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  61.64 
 
 
438 aa  549  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  61.86 
 
 
431 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.10825e-05  hitchhiker  1.53755e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  61.86 
 
 
431 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  62.09 
 
 
431 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  7.09559e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  61.86 
 
 
431 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  4.89804e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  62.09 
 
 
431 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  62.09 
 
 
431 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  4.71969e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  61.86 
 
 
431 aa  549  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  62.09 
 
 
431 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  60.37 
 
 
431 aa  548  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  60.96 
 
 
438 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1094  adenylosuccinate synthetase  62.7 
 
 
440 aa  546  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.562394  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  61.24 
 
 
437 aa  547  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  61.16 
 
 
431 aa  547  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  61.4 
 
 
437 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  7.37689e-12 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0441  adenylosuccinate synthetase  60.6 
 
 
435 aa  542  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.83493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  62.79 
 
 
430 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1739  adenylosuccinate synthetase  60.92 
 
 
448 aa  539  1e-152  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2344  adenylosuccinate synthetase  61.38 
 
 
448 aa  538  1e-152  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  60.7 
 
 
431 aa  539  1e-152  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1801  adenylosuccinate synthetase  61.15 
 
 
448 aa  540  1e-152  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1095  adenylosuccinate synthetase  61.38 
 
 
448 aa  538  1e-152  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2216  adenylosuccinate synthetase  61.15 
 
 
448 aa  538  1e-152  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.130698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1333  adenylosuccinate synthetase  61.38 
 
 
448 aa  538  1e-152  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.018876  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2178  adenylosuccinate synthetase  61.15 
 
 
448 aa  538  1e-152  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0073  adenylosuccinate synthetase  61.38 
 
 
448 aa  538  1e-152  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1823  adenylosuccinate synthetase  61.38 
 
 
448 aa  538  1e-152  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1712  adenylosuccinate synthetase  60.92 
 
 
448 aa  539  1e-152  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12828  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  60.93 
 
 
430 aa  541  1e-152  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6278  adenylosuccinate synthetase  61.15 
 
 
448 aa  540  1e-152  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1825  adenylosuccinate synthetase  61.15 
 
 
448 aa  540  1e-152  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.260214  normal  0.42401 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  60.7 
 
 
430 aa  539  1e-152  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  63.34 
 
 
431 aa  538  1e-152  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2245  adenylosuccinate synthetase  60.92 
 
 
448 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1070  adenylosuccinate synthetase  60.23 
 
 
446 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.763716  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1473  adenylosuccinate synthetase  60.46 
 
 
448 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209737  normal  0.290596 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1606  adenylosuccinate synthetase  60.46 
 
 
448 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54976  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  60.93 
 
 
431 aa  537  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  58.76 
 
 
446 aa  535  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  58.85 
 
 
446 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2076  adenylosuccinate synthetase  60.18 
 
 
446 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5102  adenylosuccinate synthetase  60.69 
 
 
448 aa  537  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2530  adenylosuccinate synthetase  60.23 
 
 
448 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00750177  hitchhiker  2.99679e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>