More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1941 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  100 
 
 		 434 aa  875    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  41.73 
 
 		 446 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  41.84 
 
 		 440 aa  319  7e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  41.63 
 
 		 430 aa  317  2e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  41.63 
 
 		 430 aa  317  4e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  39.25 
 
 		 422 aa  289  6e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  34.79 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  34.72 
 
 		 424 aa  220  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  32.41 
 
 		 426 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  30.65 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 402 aa  142  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 411 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.82 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.01 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.83 
 
 		 422 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.87 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 432 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 424 aa  113  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 412 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 425 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  23.09 
 
 		 424 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.78 
 
 		 426 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  21.73 
 
 		 416 aa  106  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 414 aa  102  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  28.9 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  21.66 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.71 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.17 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.91 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  26.81 
 
 		 426 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.74 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  25.68 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 425 aa  99  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.48 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.64 
 
 		 403 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 419 aa  97.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 419 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 444 aa  97.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 		 419 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.56 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 430 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 411 aa  94.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.79 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 436 aa  93.6  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.41 
 
 		 366 aa  93.6  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  22.19 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  21.04 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  28.91 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 419 aa  90.1  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 430 aa  90.5  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.74 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.74 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 419 aa  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  21.61 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  21.99 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  21.99 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 461 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  21.99 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>