68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1907 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1907  calcium/proton exchanger  100 
 
 
361 aa  710    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  41.85 
 
 
348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  42.13 
 
 
348 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.9 
 
 
365 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.9 
 
 
365 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  46.63 
 
 
360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3705  H+/Ca2+ exchanging protein  38.72 
 
 
354 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  43.45 
 
 
363 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  41.18 
 
 
372 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  40.43 
 
 
370 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.22 
 
 
358 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.9 
 
 
367 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  42.62 
 
 
364 aa  248  9e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1655  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.97 
 
 
379 aa  248  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  37.92 
 
 
349 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.28 
 
 
363 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1369  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.16 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  40.76 
 
 
354 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  40.47 
 
 
354 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  39.09 
 
 
351 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  40.18 
 
 
351 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0484  calcium/proton exchanger  39.88 
 
 
351 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  40.47 
 
 
354 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  40.47 
 
 
351 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  40.47 
 
 
354 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  40.18 
 
 
354 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0422  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.09 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00187889  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.71 
 
 
358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1302  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.45 
 
 
350 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0399  calcium/cation antiporter  39.88 
 
 
351 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3782  calcium/cation antiporter  40.85 
 
 
374 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.133642 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4839  calcium/proton exchanger  39.88 
 
 
351 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.35 
 
 
356 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.17 
 
 
364 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  35 
 
 
416 aa  212  7e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  36.57 
 
 
367 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  37.8 
 
 
351 aa  209  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  39.38 
 
 
354 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.662707 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  36.12 
 
 
434 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2427  calcium/proton exchanger  40.96 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.27 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  38.86 
 
 
366 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2573  calcium/proton exchanger  38.69 
 
 
331 aa  195  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.144638  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  37.33 
 
 
381 aa  196  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  33.91 
 
 
370 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07510  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  31.77 
 
 
544 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.640031  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  31.48 
 
 
348 aa  176  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02980  calcium:hydrogen antiporter, putative  32.89 
 
 
403 aa  168  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.696146  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_2762  predicted protein  26.96 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.520471  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00180  calcium ion transporter, putative  49.67 
 
 
599 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0287114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1240  sodium/calcium exchanger membrane region  33.96 
 
 
365 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1975  sodium/calcium exchanger membrane region  49.34 
 
 
189 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00510544  normal  0.677421 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07173  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  41.96 
 
 
742 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000380184  normal  0.53432 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01330  calcium ion transporter, putative  39.31 
 
 
689 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.712478  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05821  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  30.39 
 
 
481 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53985  Ca2+/H+ antiporter  23.54 
 
 
967 aa  100  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0314274  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06986  calcium/ hydrogen exchanger, putative (Eurofung)  29.19 
 
 
1129 aa  86.7  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  22.52 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  19.87 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  21.19 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05500  conserved hypothetical protein  32.77 
 
 
1344 aa  62.8  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  25.4 
 
 
359 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  23.93 
 
 
331 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.34 
 
 
325 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.94 
 
 
331 aa  46.2  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2267  calcium/sodium:proton antiporter  24.89 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2574  calcium/sodium:proton antiporter  24.47 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  22.56 
 
 
392 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>