54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1863 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  100 
 
 		 112 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000371113  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.71 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.04 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  34.68 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  34.68 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.84 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.87 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  36.45 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.64 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.84 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.09 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.07 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.62 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1024  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.45 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0737742  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.64 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.78 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.16284e-21  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.64 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  33.64 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.45 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.19 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.23 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.04 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.07 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  33.65 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  28.04 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.91 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  31.25 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.75 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.69 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3984  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.51 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49889  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.698098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2738  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.09 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3493  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.61 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.572012  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3939  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.69 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0681504  hitchhiker  0.000514453 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.98 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.98 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.29 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3562  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.23 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  0.684238 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.58 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.67 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.93 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2911  hypothetical protein  39.62 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5155  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.1 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336859  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  43.24 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  35.59 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4220  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.64 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  28.71 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.5 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386763  normal  0.64236 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  32.29 
 
 		 101 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>