More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1803 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  54.35 
 
 
238 aa  278  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  53.88 
 
 
258 aa  278  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  54.35 
 
 
238 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  53.45 
 
 
237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  56.67 
 
 
237 aa  247  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  47.64 
 
 
238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  47.21 
 
 
238 aa  241  6e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  48.96 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  48.1 
 
 
241 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  41.77 
 
 
261 aa  218  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  44.26 
 
 
264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  43.83 
 
 
264 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  47.6 
 
 
244 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  40.83 
 
 
263 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  43.04 
 
 
262 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  42.08 
 
 
263 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  40.66 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  42.15 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  41.53 
 
 
270 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  39.32 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  39.42 
 
 
268 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  40.16 
 
 
262 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  37.6 
 
 
263 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  40.51 
 
 
262 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  39.59 
 
 
262 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  39.75 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  38.24 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  42.41 
 
 
241 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  39.17 
 
 
267 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  39 
 
 
261 aa  168  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  37.7 
 
 
273 aa  166  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  37.39 
 
 
242 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  39.33 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  39.44 
 
 
241 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  39.18 
 
 
263 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  36.4 
 
 
242 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  39.44 
 
 
241 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  39.44 
 
 
241 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  35.54 
 
 
250 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  37.96 
 
 
263 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  36.44 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  39.18 
 
 
265 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  41.42 
 
 
243 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  41.42 
 
 
243 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  39.18 
 
 
263 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  38.5 
 
 
241 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  41.7 
 
 
263 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  41.18 
 
 
356 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  35.86 
 
 
318 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  36.63 
 
 
257 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  38.08 
 
 
262 aa  151  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  36.25 
 
 
237 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  36.44 
 
 
260 aa  148  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  37.92 
 
 
246 aa  148  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  38.18 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  40.51 
 
 
242 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  34.03 
 
 
264 aa  143  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  34.47 
 
 
280 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  35.62 
 
 
271 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  35.62 
 
 
234 aa  135  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  36.65 
 
 
245 aa  132  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  32.77 
 
 
261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  34.91 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  36.65 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  33.76 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  36.29 
 
 
269 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  33.49 
 
 
246 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  31.2 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  37.62 
 
 
241 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  32.91 
 
 
267 aa  116  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  36.15 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  32.63 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  31.06 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  30.39 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  36.25 
 
 
237 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  30.2 
 
 
265 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  30.2 
 
 
265 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  30.2 
 
 
265 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  31.63 
 
 
296 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  30.04 
 
 
256 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2003  dienelactone hydrolase  28.02 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  28.32 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  27.8 
 
 
290 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  27.68 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  26.4 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  31.9 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  26.89 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 
234 aa  72  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  24.88 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  28.99 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  26.13 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  29.17 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  31.28 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  25.5 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  32.02 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  30.43 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  30.4 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  29.96 
 
 
331 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>