More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1757 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.58 
 
 		 1341 aa  1820    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  100 
 
 		 1308 aa  2695    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  68.39 
 
 		 1345 aa  1804    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.38 
 
 		 1279 aa  1780    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  66.77 
 
 		 1279 aa  1757    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.56 
 
 		 1340 aa  1818    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.36 
 
 		 1304 aa  1714    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  58.94 
 
 		 1277 aa  1474    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  69.06 
 
 		 1342 aa  1836    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.16 
 
 		 1371 aa  1810    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  67.45 
 
 		 1308 aa  1723    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  36.92 
 
 		 1221 aa  762    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  70.09 
 
 		 1291 aa  1890    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  68.7 
 
 		 1324 aa  1834    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  65.12 
 
 		 1259 aa  1679    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  67 
 
 		 1309 aa  1736    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  69.13 
 
 		 1342 aa  1840    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.6 
 
 		 1292 aa  1678    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  58.94 
 
 		 1277 aa  1474    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  68.3 
 
 		 1341 aa  1834    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  37.26 
 
 		 1217 aa  729    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  69.06 
 
 		 1342 aa  1836    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  67.15 
 
 		 1364 aa  1842    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  66.77 
 
 		 1292 aa  1729    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  68.89 
 
 		 1345 aa  1815    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  58.15 
 
 		 1280 aa  1526    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  69.28 
 
 		 1359 aa  1824    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  64.28 
 
 		 1307 aa  1677    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  37.23 
 
 		 1213 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.28 
 
 		 1307 aa  1677    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  65.23 
 
 		 1307 aa  1695    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  64.64 
 
 		 1271 aa  1714    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  66.24 
 
 		 1300 aa  1726    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  67.85 
 
 		 1349 aa  1841    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  69.06 
 
 		 1342 aa  1836    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  68.12 
 
 		 1324 aa  1825    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  68.79 
 
 		 1345 aa  1810    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.42 
 
 		 1286 aa  1410    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.56 
 
 		 1304 aa  1721    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  36.68 
 
 		 1212 aa  733    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  68.58 
 
 		 1341 aa  1820    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.84 
 
 		 1289 aa  1541    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  69.13 
 
 		 1342 aa  1840    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  37.86 
 
 		 1202 aa  762    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  68.98 
 
 		 1342 aa  1837    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.77 
 
 		 1288 aa  1535    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  69.06 
 
 		 1342 aa  1836    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  69.82 
 
 		 1292 aa  1866    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.41 
 
 		 1340 aa  1814    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.62 
 
 		 1265 aa  1685    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.33 
 
 		 1344 aa  1838    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  36.6 
 
 		 1212 aa  734    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.58 
 
 		 1341 aa  1820    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.42 
 
 		 1282 aa  1356    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  37.64 
 
 		 1218 aa  744    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.44 
 
 		 1218 aa  761    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  30.62 
 
 		 1183 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  32.16 
 
 		 1188 aa  504  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  31.53 
 
 		 1197 aa  498  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  31.49 
 
 		 1183 aa  493  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.17 
 
 		 1187 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.25 
 
 		 1227 aa  406  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  35.53 
 
 		 1214 aa  393  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  37.33 
 
 		 1210 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  35.48 
 
 		 1204 aa  264  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  25.32 
 
 		 456 aa  121  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  24.52 
 
 		 430 aa  118  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.4 
 
 		 411 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.58 
 
 		 459 aa  109  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.34 
 
 		 434 aa  108  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.82 
 
 		 459 aa  105  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  21.76 
 
 		 460 aa  100  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.5 
 
 		 413 aa  100  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  23.67 
 
 		 461 aa  100  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  21.53 
 
 		 460 aa  99.8  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  21.53 
 
 		 460 aa  99.8  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.66 
 
 		 413 aa  99.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.86 
 
 		 460 aa  99.4  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.94 
 
 		 418 aa  99.4  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  27.06 
 
 		 457 aa  99  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  26.21 
 
 		 413 aa  98.6  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  27.29 
 
 		 460 aa  98.2  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  25.4 
 
 		 987 aa  97.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 		 466 aa  95.9  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1167  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.6 
 
 		 404 aa  95.5  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.52 
 
 		 469 aa  95.5  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.23 
 
 		 456 aa  95.1  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  24.43 
 
 		 485 aa  94.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  23.01 
 
 		 423 aa  94  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  21.6 
 
 		 421 aa  93.6  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  22.99 
 
 		 461 aa  93.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  24.95 
 
 		 431 aa  93.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  26.18 
 
 		 489 aa  92.8  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.75 
 
 		 475 aa  92.8  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.94 
 
 		 493 aa  92.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  23.94 
 
 		 459 aa  92  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.76 
 
 		 486 aa  92  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  24.15 
 
 		 459 aa  91.7  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.29 
 
 		 468 aa  91.7  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  25.56 
 
 		 501 aa  90.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>