129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1729 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  48.05 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  29.82 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  29.6 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  48 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  40.74 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  29.69 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  32.1 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  32.93 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  32.56 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  27.42 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  33.7 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  31.76 
 
 
151 aa  62  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  34.18 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  35.23 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  35.23 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  35.23 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  34.09 
 
 
146 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  31.71 
 
 
155 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  31.4 
 
 
143 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  31.71 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  37.8 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  29.76 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  27.66 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  31.3 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  28.72 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  25.74 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  30.67 
 
 
135 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  38.89 
 
 
131 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  30.88 
 
 
145 aa  51.6  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  30.26 
 
 
122 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  33.77 
 
 
130 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4337  protein of unknown function DUF1232  32.17 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  40.68 
 
 
139 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  33.77 
 
 
130 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  28.28 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  25.62 
 
 
116 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4315  protein of unknown function DUF1232  32.17 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  36.21 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  30.12 
 
 
110 aa  49.3  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  37.35 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  57.14 
 
 
386 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  31.11 
 
 
124 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  32.81 
 
 
116 aa  48.5  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  27.27 
 
 
116 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  24.79 
 
 
116 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  43.55 
 
 
249 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  43.33 
 
 
130 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  30.59 
 
 
152 aa  47.4  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  24.79 
 
 
117 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  30.43 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  24.79 
 
 
116 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  24.79 
 
 
116 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  41.27 
 
 
142 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  28 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  26.26 
 
 
116 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  28.92 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  27.27 
 
 
108 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  27.85 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  26.26 
 
 
116 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  31.75 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  38.03 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  51.35 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  36.51 
 
 
97 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 
217 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  29.76 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  37.25 
 
 
150 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  28.77 
 
 
119 aa  45.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  29.41 
 
 
115 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  40.68 
 
 
124 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  55 
 
 
130 aa  44.3  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  43.64 
 
 
135 aa  43.9  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  29.33 
 
 
112 aa  43.9  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  35.59 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  32.81 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  39.66 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  35.85 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  56.67 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  40.91 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 
121 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  29.31 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  42.5 
 
 
132 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  27.27 
 
 
116 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  26.67 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  38.46 
 
 
91 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  32.2 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  52.78 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  33.96 
 
 
98 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  31.48 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  33.82 
 
 
127 aa  42.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4824  DNA-binding protein  38.89 
 
 
217 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0158337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  34.92 
 
 
97 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  37.25 
 
 
96 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  33.82 
 
 
127 aa  42.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  38.67 
 
 
126 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>