More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1727 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  60.51 
 
 
315 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  58.15 
 
 
327 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  61.34 
 
 
313 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  59.12 
 
 
326 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.83 
 
 
315 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  58.73 
 
 
315 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  56.82 
 
 
313 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  62.34 
 
 
321 aa  358  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  65.71 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  58.13 
 
 
320 aa  355  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  61.92 
 
 
323 aa  355  7.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  53.04 
 
 
313 aa  345  8e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  53.04 
 
 
341 aa  345  8e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  57.54 
 
 
325 aa  340  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.49 
 
 
313 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.4 
 
 
326 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  57.54 
 
 
331 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  57.62 
 
 
331 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  52.15 
 
 
326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.46 
 
 
347 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  50.63 
 
 
304 aa  285  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.46 
 
 
313 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  50.16 
 
 
319 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.96 
 
 
324 aa  279  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.11 
 
 
331 aa  278  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.11 
 
 
324 aa  275  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  52.88 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  52.88 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  47.73 
 
 
313 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  49.18 
 
 
296 aa  265  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  48.85 
 
 
296 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  50.16 
 
 
295 aa  261  8.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  47.62 
 
 
316 aa  256  5e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.48 
 
 
317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  47.9 
 
 
314 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  47.28 
 
 
297 aa  247  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  46.93 
 
 
314 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  44.23 
 
 
306 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  44.23 
 
 
306 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  44.23 
 
 
306 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  44.23 
 
 
306 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  44.23 
 
 
306 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  43.27 
 
 
306 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  43.27 
 
 
306 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  43.27 
 
 
306 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  43.27 
 
 
306 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  43.27 
 
 
306 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  43.27 
 
 
306 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  43.27 
 
 
306 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  42.95 
 
 
306 aa  242  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  42.95 
 
 
306 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  43.61 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  45.11 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.11 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  43.37 
 
 
324 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  41.45 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.94 
 
 
339 aa  232  6e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  43.17 
 
 
314 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.62 
 
 
323 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  37.96 
 
 
330 aa  227  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.54 
 
 
316 aa  225  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  45.11 
 
 
316 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  43.3 
 
 
320 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  41.95 
 
 
328 aa  222  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  45.83 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.99 
 
 
318 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  44.27 
 
 
313 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  40 
 
 
324 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  42.09 
 
 
307 aa  215  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  41.95 
 
 
311 aa  215  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.56 
 
 
289 aa  215  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  44.81 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1433  DnaJ protein  45.42 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.75 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1364  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.28 
 
 
293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  44.27 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0647  chaperone DnaJ domain protein  43.64 
 
 
337 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  46.34 
 
 
318 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  42.63 
 
 
309 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  40.79 
 
 
311 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  41.2 
 
 
287 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  42.27 
 
 
294 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0039  heat shock protein DnaJ  38.34 
 
 
332 aa  206  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  39.04 
 
 
326 aa  206  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.49 
 
 
316 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.03 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.62 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  37.91 
 
 
299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  41.36 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.81 
 
 
315 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  37.58 
 
 
301 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.47 
 
 
334 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.78 
 
 
392 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  36.55 
 
 
335 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  35.88 
 
 
333 aa  188  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  35.26 
 
 
337 aa  188  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  42.09 
 
 
318 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.27 
 
 
291 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.94 
 
 
351 aa  186  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.219392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>