More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1715 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1715  sensor histidine kinase  100 
 
 		 517 aa  1042    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.443764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0913  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1057  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 491 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 518 aa  293  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2496  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  37.63 
 
 		 481 aa  282  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  35.22 
 
 		 506 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 515 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4270  sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 511 aa  256  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 494 aa  249  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  35.16 
 
 		 475 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1119  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 473 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 495 aa  219  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2769  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 484 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.678535  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 518 aa  216  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  41.16 
 
 		 475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  41.16 
 
 		 475 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1112  histidine kinase  41.16 
 
 		 460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660046  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  41.16 
 
 		 460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  41.16 
 
 		 475 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  41.16 
 
 		 475 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 		 475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2709  sensor histidine kinase  40.82 
 
 		 475 aa  213  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 473 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  40.82 
 
 		 475 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 486 aa  209  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1802  sensor histidine kinase  32.25 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.580207  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1224  histidine kinase  38.97 
 
 		 486 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.925604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 477 aa  189  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0516551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 478 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2770  histidine kinase  37.55 
 
 		 477 aa  183  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1083  histidine kinase  35.76 
 
 		 477 aa  179  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1601  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3051  histidine kinase  37.63 
 
 		 478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01721  two-component system sensor kinase  36.86 
 
 		 469 aa  173  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1150  putative sensor-like histidine kinase YfhK  35.34 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3627  two-component system sensor kinase  35.34 
 
 		 475 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  29.45 
 
 		 466 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  29.45 
 
 		 466 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  29.45 
 
 		 466 aa  160  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  29.45 
 
 		 466 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  29.45 
 
 		 466 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  28.8 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  28.8 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  28.8 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 488 aa  153  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  26.98 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 614 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  33.22 
 
 		 363 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 458 aa  140  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 487 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  24.7 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  26.39 
 
 		 458 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  26.39 
 
 		 458 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  26.69 
 
 		 458 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  33.33 
 
 		 593 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  28.28 
 
 		 508 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  32.99 
 
 		 347 aa  136  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 631 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 396 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 639 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 639 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 639 aa  134  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  33.9 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  33.74 
 
 		 409 aa  131  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  30.56 
 
 		 389 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  34.95 
 
 		 857 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 625 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  31.65 
 
 		 360 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 469 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 633 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  27.89 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  25.34 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  27.09 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 920 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  27.65 
 
 		 351 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  27.65 
 
 		 351 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 620 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 723 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  33.95 
 
 		 347 aa  127  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  26.26 
 
 		 518 aa  127  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 614 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 609 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>