More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1602 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 283 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  67.16 
 
 		 277 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  64.91 
 
 		 268 aa  337  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  63.93 
 
 		 268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  62.7 
 
 		 308 aa  291  9e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  55.6 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  64.42 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  52.42 
 
 		 250 aa  263  3e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  53.88 
 
 		 279 aa  258  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  49.8 
 
 		 246 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  55.45 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  49.6 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  49.19 
 
 		 247 aa  235  7e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  47.15 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  50.41 
 
 		 239 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  50.21 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  49.6 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  48.59 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  51.8 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  51.4 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  47.22 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  52.07 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  49.2 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  54.21 
 
 		 283 aa  225  7e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  47.88 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  49.17 
 
 		 244 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  44.65 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  47.47 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  53.11 
 
 		 277 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  50.7 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  46.37 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  48.79 
 
 		 258 aa  215  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  56.1 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  48.47 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  54.15 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  48.4 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  46.46 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  49.37 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  49.05 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  51.4 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  52.36 
 
 		 273 aa  212  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  49.52 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  52.68 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  52.68 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.68 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  52.68 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  51.87 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.68 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.68 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.68 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  52.36 
 
 		 281 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.68 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  52.36 
 
 		 277 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  47.86 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  48.76 
 
 		 242 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  52.36 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.2 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  47.86 
 
 		 266 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  48.56 
 
 		 218 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  45.15 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  52.36 
 
 		 285 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  53.62 
 
 		 301 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  51.17 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  47.27 
 
 		 225 aa  205  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.97 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  53.4 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  45.45 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  42.75 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.2 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.2 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.2 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  45.78 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.15 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.15 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  46.86 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  45.57 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  45.37 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3200  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  56.76 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  51.92 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  51.38 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2018  hydrogenase accessory protein HypB  47.5 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  47.73 
 
 		 284 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  51.42 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  47.73 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  46.44 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  52.48 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  51.44 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  43.38 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3881  hydrogenase accessory protein HypB  47.88 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785177 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  47.12 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  48.64 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  42.38 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  47.22 
 
 		 227 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  41.83 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1307  hydrogenase accessory protein HypB  47.6 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00162338  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  51.42 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  47.08 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  48.83 
 
 		 226 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>