More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1494 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  100 
 
 		 455 aa  934    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  62.85 
 
 		 444 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  66.06 
 
 		 445 aa  592  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  64.72 
 
 		 439 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  64.72 
 
 		 439 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  63.64 
 
 		 449 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  62.87 
 
 		 449 aa  552  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  62.53 
 
 		 444 aa  547  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  57.21 
 
 		 455 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  54.73 
 
 		 444 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  44.68 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  39.51 
 
 		 470 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  38.51 
 
 		 491 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  37.71 
 
 		 495 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  38.84 
 
 		 507 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  32.73 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  32.23 
 
 		 416 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  32.73 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  32.68 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  30.77 
 
 		 413 aa  176  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  36.86 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  29.35 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  30.31 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  28.72 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  35.89 
 
 		 480 aa  170  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  31.38 
 
 		 429 aa  169  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  30.21 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  29.95 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  30.23 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  28.5 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  29.19 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  29.19 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  29.95 
 
 		 435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  29.19 
 
 		 429 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  29.7 
 
 		 435 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  31.01 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  32.13 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  29.44 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  29.77 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  31.78 
 
 		 413 aa  161  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  28.87 
 
 		 415 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  32.69 
 
 		 414 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  30.23 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  33.08 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  29.77 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  33.17 
 
 		 419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  31.43 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  30 
 
 		 415 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  30 
 
 		 415 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  37.17 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  37.46 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  37.17 
 
 		 480 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  37.17 
 
 		 480 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  32.7 
 
 		 587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  30.65 
 
 		 409 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  26.92 
 
 		 417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  34.96 
 
 		 584 aa  153  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  30.87 
 
 		 439 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  27.25 
 
 		 424 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  27.04 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 		 647 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  30.77 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  29.95 
 
 		 415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  29.67 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  25.71 
 
 		 416 aa  142  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 455 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  28.89 
 
 		 384 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  33.74 
 
 		 618 aa  123  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 563 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  30.03 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 566 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 606 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 566 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 566 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.81 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  25.86 
 
 		 566 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  25.86 
 
 		 566 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 457 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  25.86 
 
 		 566 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 		 424 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.23 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 566 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.23 
 
 		 425 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 431 aa  93.2  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 398 aa  93.2  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 		 398 aa  93.2  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 549 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 344 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.74 
 
 		 423 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  25.07 
 
 		 552 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  25.07 
 
 		 552 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  25.36 
 
 		 552 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>