More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1432 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
427 aa  849    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  30.14 
 
 
417 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4272  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.553747  normal  0.320513 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1702  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
406 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3655  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 
442 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2505  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4368  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0158935  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2188  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.777169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4365  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
422 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.893788 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
392 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  40.48 
 
 
399 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  36.8 
 
 
356 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0228  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
407 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219003  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  40.22 
 
 
353 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
373 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
366 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  37.63 
 
 
406 aa  96.7  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
380 aa  96.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
394 aa  96.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
405 aa  96.3  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  37.38 
 
 
638 aa  96.3  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
408 aa  96.3  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
458 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  37.22 
 
 
373 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2892  a-glycosyltransferase  22.99 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000152395  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 
384 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
396 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
467 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
426 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
420 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  40.71 
 
 
440 aa  90.9  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  37.75 
 
 
394 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
377 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
409 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  36.21 
 
 
389 aa  89.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 
413 aa  89.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  31.2 
 
 
404 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
414 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
453 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.87 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
421 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  33.16 
 
 
415 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
393 aa  88.2  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  25.49 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  37.75 
 
 
414 aa  87.4  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
381 aa  87.4  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 
402 aa  87  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
437 aa  87  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
414 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
378 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 
391 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
398 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
452 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.35 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  36.44 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.02 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
904 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  36.06 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.56 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
416 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 
346 aa  84  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
421 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
432 aa  84  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  27.19 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  34.58 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  36.95 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  39.25 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  30.27 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  35.52 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  35.52 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.39 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>