More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1355 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  100 
 
 		 427 aa  867    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  68.02 
 
 		 429 aa  611  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  68.82 
 
 		 425 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.83 
 
 		 426 aa  588  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.46 
 
 		 454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  61.46 
 
 		 445 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  61.46 
 
 		 445 aa  531  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  61.46 
 
 		 445 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  61.54 
 
 		 445 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  61.46 
 
 		 445 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  61.46 
 
 		 445 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  61.46 
 
 		 445 aa  531  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  61.46 
 
 		 445 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.793863 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  61.46 
 
 		 445 aa  532  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  61.46 
 
 		 445 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  61.46 
 
 		 445 aa  532  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  61.46 
 
 		 445 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  61.46 
 
 		 445 aa  532  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  61.46 
 
 		 445 aa  532  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  61.46 
 
 		 445 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  61.65 
 
 		 450 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  59.2 
 
 		 461 aa  524  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  59.2 
 
 		 461 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  59.2 
 
 		 461 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  59.81 
 
 		 449 aa  521  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  59.57 
 
 		 449 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1742  NADH dehydrogenase I subunit F  58.57 
 
 		 453 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00767478  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4123  NADH dehydrogenase I subunit F  58.57 
 
 		 453 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1869  NADH dehydrogenase I subunit F  58.81 
 
 		 458 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.123144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3695  NADH dehydrogenase I subunit F  58.57 
 
 		 454 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1017  NADH dehydrogenase I subunit F  59.95 
 
 		 461 aa  509  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2566  NADH dehydrogenase I subunit F  59.05 
 
 		 448 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28480  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.81 
 
 		 449 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2546  NADH dehydrogenase I subunit F  61.89 
 
 		 449 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698943  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1116  NADH dehydrogenase (quinone)  58.51 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1398  NADH dehydrogenase I subunit F  62.14 
 
 		 449 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.940574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3369  NADH dehydrogenase I, F subunit  58 
 
 		 452 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3201  NADH dehydrogenase I subunit F  57.76 
 
 		 452 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103684  normal  0.0135586 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0377  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.47 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.372414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2416  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.05 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0718255  normal  0.148536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3607  NADH dehydrogenase I subunit F  57.14 
 
 		 451 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0714  NADH dehydrogenase (quinone)  62.11 
 
 		 428 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1695  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.09 
 
 		 537 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.316564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0588  NADH dehydrogenase I, F subunit  56.7 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3128  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  57.73 
 
 		 446 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0577  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  56.46 
 
 		 474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29970  NADH dehydrogenase I subunit F  55.08 
 
 		 449 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0157  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  54.68 
 
 		 422 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0329  NADH dehydrogenase (quinone)  54.32 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3441  NADH dehydrogenase I, F subunit  53.48 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0208  NADH dehydrogenase I chain F  55.4 
 
 		 425 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4067  NADH dehydrogenase (quinone)  54.27 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0902793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0158  NADH dehydrogenase (quinone)  53 
 
 		 421 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589974 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.29 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0176  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  52.52 
 
 		 421 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.03 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.53 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.09 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.27 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.98 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1693  NADH dehydrogenase (quinone)  51.67 
 
 		 416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0681624  normal  0.883791 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0104  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  51.54 
 
 		 416 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1740  NADH dehydrogenase (quinone)  51.54 
 
 		 416 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.39 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.1 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.75 
 
 		 706 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.51 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4739  NADH dehydrogenase (quinone)  53.7 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.99 
 
 		 431 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  49.36 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.26 
 
 		 434 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.88 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 		 446 aa  396  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  48.93 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.01 
 
 		 443 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.13 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.25 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.25 
 
 		 451 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  49.88 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1279  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  48.98 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1330  NADH dehydrogenase (quinone)  53.7 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  48.35 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  50.13 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  46.23 
 
 		 545 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.18 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.96 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.51 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.13 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  46.62 
 
 		 545 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1351  NADH dehydrogenase (quinone)  52.51 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.169855 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.51 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  46.5 
 
 		 545 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  48.54 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.52 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  47.94 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.82 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.49 
 
 		 438 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  45.72 
 
 		 539 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>