42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1278 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  740    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  49.17 
 
 		 391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  50.55 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  50.41 
 
 		 411 aa  342  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  48.63 
 
 		 392 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  50.15 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  47.8 
 
 		 420 aa  328  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  48.49 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  48.49 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  51 
 
 		 424 aa  326  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  49.71 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  49.71 
 
 		 422 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  47.11 
 
 		 386 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  47.4 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  51.14 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  46.96 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  45.65 
 
 		 400 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  48.99 
 
 		 402 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  45.77 
 
 		 410 aa  299  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  45.8 
 
 		 429 aa  299  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  47.09 
 
 		 412 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  45.35 
 
 		 393 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  46.22 
 
 		 395 aa  289  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  44.61 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  44.31 
 
 		 369 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  41.54 
 
 		 400 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  40.06 
 
 		 408 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  39.5 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  40.66 
 
 		 416 aa  259  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  41.95 
 
 		 395 aa  259  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  46 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  39.88 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  40.55 
 
 		 391 aa  209  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  41.32 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  39.17 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  23.27 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  21.55 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  24.07 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  21.7 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  21.18 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  23.97 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  21.62 
 
 		 445 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>