More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1251 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 420 aa  858    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  74.76 
 
 		 421 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  74.46 
 
 		 419 aa  653    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  75.54 
 
 		 420 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  72.51 
 
 		 418 aa  633  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  70.95 
 
 		 421 aa  629  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  69.08 
 
 		 419 aa  607  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  67.86 
 
 		 420 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  70.67 
 
 		 419 aa  587  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  66.43 
 
 		 420 aa  581  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  66.43 
 
 		 420 aa  580  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  66.18 
 
 		 414 aa  578  1e-164  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  66.18 
 
 		 414 aa  579  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  58.74 
 
 		 419 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  61.17 
 
 		 418 aa  472  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  61.24 
 
 		 418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  55.37 
 
 		 421 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  58.61 
 
 		 417 aa  461  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  58.37 
 
 		 427 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  55.72 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  57.28 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  54.09 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  48.15 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  49.5 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  45.06 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  46.9 
 
 		 422 aa  348  9e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  45.26 
 
 		 415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  49.4 
 
 		 417 aa  341  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  44.34 
 
 		 418 aa  336  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  44.93 
 
 		 415 aa  330  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 414 aa  325  8.000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  43.93 
 
 		 415 aa  319  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  44.83 
 
 		 409 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  40.74 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  40.39 
 
 		 408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  37.89 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  36.62 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  36.62 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  37.53 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  35.37 
 
 		 447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  36.97 
 
 		 403 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  33.48 
 
 		 460 aa  222  8e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  36.26 
 
 		 404 aa  220  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  36.71 
 
 		 402 aa  219  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  39.51 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  35.55 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  35.85 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  34.86 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  34.43 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  32.85 
 
 		 406 aa  182  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  34.15 
 
 		 378 aa  163  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  31.11 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  33.25 
 
 		 402 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  30.27 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  32.55 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  33.47 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  29.83 
 
 		 348 aa  106  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  36.52 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.27 
 
 		 346 aa  106  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  32.93 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  31.02 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  29.55 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  30.8 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  30.83 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  30.66 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  33.2 
 
 		 341 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  37.14 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  27.27 
 
 		 340 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  34.54 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  35.14 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  37.68 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  35.45 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  35.15 
 
 		 343 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  35.62 
 
 		 359 aa  96.7  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  34.31 
 
 		 341 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  35.16 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  33.93 
 
 		 341 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  27.13 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  33.07 
 
 		 343 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  31.75 
 
 		 343 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  31.75 
 
 		 343 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  31.75 
 
 		 343 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  31.47 
 
 		 360 aa  94  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  33.2 
 
 		 343 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  26.27 
 
 		 341 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  30.43 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  42.86 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  27.76 
 
 		 341 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  33.18 
 
 		 344 aa  90.1  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  32.98 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  31.2 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  29.69 
 
 		 345 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  33.49 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  35.32 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  30 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  27.17 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  29.96 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  33.46 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  31.41 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  27.98 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>