More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1232 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  100 
 
 		 215 aa  440  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  68.42 
 
 		 234 aa  300  9e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  67.13 
 
 		 215 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  67.14 
 
 		 223 aa  295  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  66.67 
 
 		 226 aa  293  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  66.99 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  63.81 
 
 		 217 aa  292  3e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  66.05 
 
 		 216 aa  292  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  67.44 
 
 		 215 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  66.2 
 
 		 264 aa  291  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  63.33 
 
 		 217 aa  287  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  65.07 
 
 		 213 aa  286  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  65.58 
 
 		 215 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  65.58 
 
 		 215 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  65.12 
 
 		 215 aa  284  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  64.11 
 
 		 213 aa  281  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  64.11 
 
 		 213 aa  281  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  65.58 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  64.29 
 
 		 216 aa  278  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  65.07 
 
 		 233 aa  278  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  66.05 
 
 		 215 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  61.43 
 
 		 212 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  62.91 
 
 		 217 aa  276  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  62.91 
 
 		 217 aa  276  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  60.66 
 
 		 212 aa  274  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  65.12 
 
 		 215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  63.38 
 
 		 214 aa  271  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  63.38 
 
 		 214 aa  271  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  62.2 
 
 		 213 aa  270  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  59.52 
 
 		 227 aa  265  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  61.79 
 
 		 232 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  64.77 
 
 		 193 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  51.54 
 
 		 244 aa  240  9e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  51.98 
 
 		 244 aa  239  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  51.54 
 
 		 245 aa  239  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  49.76 
 
 		 210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  51.2 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  49.29 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  49.07 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  49.03 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  48.06 
 
 		 211 aa  194  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  46.92 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  44.71 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  47.32 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  46.34 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  45.16 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  46.34 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  45.37 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  45.5 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  45.37 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  41.1 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  39.34 
 
 		 209 aa  161  8.000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  43.14 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  43.63 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  43.07 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  40.49 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  38.81 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  33.74 
 
 		 220 aa  99.4  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  34.23 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  33.63 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 		 280 aa  88.6  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  32.73 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  37.39 
 
 		 274 aa  85.9  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  31.14 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  28.21 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  35.05 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  40.68 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  30.84 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  32.91 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  29.7 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  27.51 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  28.07 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  29.79 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  29.36 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  28.5 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  28.39 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  28.7 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  26.38 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  29.53 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  31.17 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  32.79 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  32.79 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  32.79 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  24.12 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  32.79 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  32.79 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>