68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1184 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  932  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  45.32 
 
 
455 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  43.86 
 
 
474 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  37.25 
 
 
442 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  41.16 
 
 
466 aa  290  5e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  41.16 
 
 
466 aa  290  5e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  41.16 
 
 
466 aa  289  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  41.16 
 
 
466 aa  289  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  41.16 
 
 
466 aa  289  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  41.16 
 
 
466 aa  289  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  40.26 
 
 
470 aa  285  2e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  41.15 
 
 
473 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  43.47 
 
 
462 aa  276  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.57 
 
 
453 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  34.97 
 
 
445 aa  259  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  38.01 
 
 
466 aa  259  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  38.2 
 
 
470 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  37.01 
 
 
474 aa  253  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  40.17 
 
 
460 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  40.99 
 
 
460 aa  252  8e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  40.99 
 
 
460 aa  252  8e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  37.39 
 
 
471 aa  249  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.3 
 
 
455 aa  246  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  37.93 
 
 
469 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  38.15 
 
 
469 aa  243  4e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.39 
 
 
443 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  34.97 
 
 
467 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.29 
 
 
468 aa  236  5e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  36.99 
 
 
464 aa  233  4e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
445 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  36.09 
 
 
455 aa  233  7e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  34.05 
 
 
467 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  36.07 
 
 
473 aa  228  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.74 
 
 
475 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  35.59 
 
 
471 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.44 
 
 
883 aa  223  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  36.67 
 
 
444 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  40.91 
 
 
1751 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  32.97 
 
 
456 aa  213  5e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  32.24 
 
 
453 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.73 
 
 
482 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  35.01 
 
 
479 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
485 aa  194  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 
480 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.22 
 
 
481 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  31.11 
 
 
454 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  30.16 
 
 
478 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
478 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
523 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  29.19 
 
 
468 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  29.61 
 
 
499 aa  147  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  28.66 
 
 
466 aa  146  8e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  28.38 
 
 
468 aa  140  4e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  29.67 
 
 
633 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  26.54 
 
 
458 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.48 
 
 
608 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  22.53 
 
 
506 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  43.68 
 
 
125 aa  75.5  2e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  32.49 
 
 
490 aa  72.8  1e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  32.35 
 
 
477 aa  64.7  4e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  32.64 
 
 
593 aa  64.3  4e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  18.76 
 
 
494 aa  63.9  6e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  18.02 
 
 
500 aa  59.3  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  18.02 
 
 
500 aa  59.3  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  28.19 
 
 
507 aa  50.4  7e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  54.35 
 
 
61 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  23.98 
 
 
572 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  41.18 
 
 
239 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>