More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1175 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  100 
 
 		 152 aa  304  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  52.94 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  52.67 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  52.98 
 
 		 177 aa  157  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  48.05 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  45.33 
 
 		 178 aa  140  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  44 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  44.37 
 
 		 185 aa  134  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  42.11 
 
 		 193 aa  130  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  38.26 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  42.11 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  39.33 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  40.67 
 
 		 200 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  38.67 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 192 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  39.35 
 
 		 208 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  38.93 
 
 		 221 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  35.1 
 
 		 234 aa  103  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  36.67 
 
 		 195 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  36.67 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  34.67 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  36 
 
 		 219 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  38 
 
 		 192 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  38 
 
 		 192 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  37.33 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  37.33 
 
 		 192 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  40.68 
 
 		 205 aa  99.4  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  37.33 
 
 		 247 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  36 
 
 		 196 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  34.44 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 195 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  36.62 
 
 		 264 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  33.55 
 
 		 238 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 193 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  36.67 
 
 		 186 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  35.06 
 
 		 216 aa  94.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  35.33 
 
 		 213 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  34 
 
 		 196 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  33.77 
 
 		 235 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 191 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  42.06 
 
 		 270 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 191 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  36.18 
 
 		 191 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  36 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  34.67 
 
 		 220 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  39.68 
 
 		 237 aa  88.2  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  35.8 
 
 		 243 aa  85.5  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  38.18 
 
 		 419 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  38.66 
 
 		 206 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  40.5 
 
 		 277 aa  83.6  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  36.31 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  39.09 
 
 		 276 aa  81.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  37.38 
 
 		 451 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  40 
 
 		 281 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  37.38 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  39.82 
 
 		 410 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  36.89 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  35.48 
 
 		 417 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  35.77 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  35.16 
 
 		 268 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  31.87 
 
 		 270 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  31.25 
 
 		 249 aa  77  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  36.97 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  34.17 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  39.81 
 
 		 441 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  32.28 
 
 		 356 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  37.1 
 
 		 427 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  34.43 
 
 		 192 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  34.43 
 
 		 192 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  37.78 
 
 		 393 aa  73.9  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  34.97 
 
 		 351 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  32.28 
 
 		 429 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  34.71 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  32.26 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 410 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  35.29 
 
 		 410 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  36.09 
 
 		 426 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  33.59 
 
 		 298 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  33.61 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  37.4 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  32.34 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  32.34 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 437 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  32.34 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  32.34 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.34 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.34 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.34 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.34 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 207 aa  70.5  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  34.71 
 
 		 253 aa  70.5  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  28.92 
 
 		 210 aa  70.5  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  31.14 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.34 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  31.19 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  31.11 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  29.33 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.34 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.34 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>