More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1124 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1124  competence protein F  100 
 
 		 233 aa  472  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  49.78 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  46.29 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  45.49 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  41.55 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  38.77 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  38.77 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  41.95 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  41.53 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  41.63 
 
 		 247 aa  158  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  40.37 
 
 		 243 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  42.06 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  45.49 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  42.53 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  39.27 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  43.2 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  37.66 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  39.17 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  41.33 
 
 		 263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  41.33 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  38.63 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  37.74 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  34.65 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  40.64 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  41.01 
 
 		 238 aa  144  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  38.18 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  38.72 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  44.54 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  37.27 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.24 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  38.64 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  41.2 
 
 		 241 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.82 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  38.5 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  38.97 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  37.61 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  38.65 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  38.65 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  39.13 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  34.87 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  41.2 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  33.33 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  38.65 
 
 		 227 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  38.16 
 
 		 227 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  37.17 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  40.1 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  41.06 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  34.58 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  40.1 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  40.58 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  40.1 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  40.1 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  40.1 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  40.78 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  38.84 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  38.57 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  33.63 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  38.46 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  33.76 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  39.81 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  39.61 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  31.42 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3458  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  33.78 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  34.98 
 
 		 268 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  39.61 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  34.98 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  35.56 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  38.39 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  36.07 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  36.24 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 		 261 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  35.83 
 
 		 255 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  34.33 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  33.48 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  37.02 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  36.84 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  36.12 
 
 		 249 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  35.71 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  39.15 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  34.5 
 
 		 263 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  36.55 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  34.5 
 
 		 263 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  35.29 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  40.65 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  37.27 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  35.68 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  34.5 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  36.05 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  35.71 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  37.22 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  35.53 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  35.92 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  33.77 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  33.33 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  38.4 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>