More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1105 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00692  cytochrome d terminal oxidase, subunit I  64.91 
 
 
522 aa  711    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.117055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1535  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  63.87 
 
 
525 aa  699    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.131601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2903  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  64.91 
 
 
522 aa  711    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00339201  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0836  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  64.58 
 
 
522 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.664102  normal  0.640825 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0654  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  64.91 
 
 
522 aa  711    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00624409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1105  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  100 
 
 
525 aa  1060    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3095  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  65.83 
 
 
522 aa  720    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1876  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  64.18 
 
 
528 aa  715    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0888533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3286  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  66.99 
 
 
518 aa  740    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0365  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  63.99 
 
 
530 aa  691    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0867  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  64.58 
 
 
522 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0630477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2738  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  63.67 
 
 
525 aa  698    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1388  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit I  65.38 
 
 
522 aa  719    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0803  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  64.58 
 
 
522 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0327801  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0484  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  69.05 
 
 
526 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3178  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  67.74 
 
 
531 aa  745    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00681  hypothetical protein  64.91 
 
 
522 aa  711    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.159246  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1204  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  59.05 
 
 
510 aa  643    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1210  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  58.65 
 
 
510 aa  640    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19890  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  68.16 
 
 
537 aa  753    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0785  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  64.91 
 
 
522 aa  711    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000321454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0755  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  64.91 
 
 
522 aa  711    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0332587  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1384  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  66.8 
 
 
518 aa  738    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362762  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01602  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  65.57 
 
 
528 aa  719    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0561  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  67.74 
 
 
531 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0729  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  67.74 
 
 
531 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1565  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  67.38 
 
 
518 aa  721    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576411  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2993  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  66.8 
 
 
518 aa  738    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.335828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1271  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  64.02 
 
 
522 aa  714    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286336  hitchhiker  0.000221787 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6147  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  67.95 
 
 
526 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0327  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  60.85 
 
 
532 aa  653    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196917 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03804  putative cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  62.75 
 
 
526 aa  668    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0299  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  67.05 
 
 
529 aa  724    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0898  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  64.58 
 
 
522 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.346957  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3137  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  66.8 
 
 
518 aa  737    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0660944  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0454  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  67.24 
 
 
531 aa  741    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2979  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  66.8 
 
 
518 aa  737    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000559301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0929  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  66.22 
 
 
524 aa  709    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00513286  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2362  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  62.84 
 
 
524 aa  671    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1441  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  67.74 
 
 
531 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.778663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1908  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  66.67 
 
 
535 aa  722    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522276  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1435  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  66.15 
 
 
541 aa  728    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000298443  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4148  putative cytochrome bd ubiquinol oxidase,subunit I  66.67 
 
 
535 aa  722    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0545  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  67.74 
 
 
531 aa  745    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1274  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  65.7 
 
 
521 aa  726    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2876  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  65.38 
 
 
522 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0645445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3118  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  65.83 
 
 
518 aa  724    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.358034  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1148  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  64.16 
 
 
522 aa  715    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2203  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  67.69 
 
 
526 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.48101  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2828  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  68.08 
 
 
526 aa  739    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1452  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  65.24 
 
 
528 aa  723    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000141499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0835  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  64.91 
 
 
522 aa  711    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0025291  normal  0.492796 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0256  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit I  58.53 
 
 
521 aa  635    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1239  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  67.57 
 
 
518 aa  744    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0361828  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1302  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  67.96 
 
 
518 aa  743    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000643415  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1310  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  67.57 
 
 
518 aa  744    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0091188  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0761  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  64.91 
 
 
522 aa  711    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0041514  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1142  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  66.22 
 
 
518 aa  726    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2877  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  68.02 
 
 
525 aa  735    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1505  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  64.11 
 
 
524 aa  710    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.781971  unclonable  0.00000000000506966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1241  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  65.63 
 
 
522 aa  724    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.476445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1230  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  62.72 
 
 
522 aa  694    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.531516  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2923  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  64.91 
 
 
522 aa  711    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.672765  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0568  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  66.54 
 
 
530 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0497351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1890  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  66.34 
 
 
529 aa  725    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2817  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  67.69 
 
 
526 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003921  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  65.38 
 
 
528 aa  725    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000934813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2910  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  64.47 
 
 
521 aa  714    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2868  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  67.74 
 
 
531 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1241  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  67.57 
 
 
518 aa  743    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00294724  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2641  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  67.18 
 
 
518 aa  742    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000351887  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2735  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  68.22 
 
 
525 aa  741    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.105689  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0776  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  64.58 
 
 
522 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128366  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2349  cytochrome bd-I oxidase subunit I  68.54 
 
 
518 aa  749    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00263445  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0720  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  65.18 
 
 
526 aa  695    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2964  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  65.38 
 
 
522 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1318  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  66.8 
 
 
518 aa  742    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0277706  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0148  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  67.74 
 
 
531 aa  745    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.524931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2397  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  60.59 
 
 
528 aa  623  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174405  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2712  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  60.08 
 
 
527 aa  619  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00013587  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0510  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  58.93 
 
 
525 aa  615  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0444  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  58.73 
 
 
525 aa  611  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.833779  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3541  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  59.33 
 
 
525 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259906  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1560  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  58.11 
 
 
529 aa  608  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0517929  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3367  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  58.38 
 
 
534 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6534  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  59.13 
 
 
526 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.324444 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6119  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  58.93 
 
 
526 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0261371  normal  0.512967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1360  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  57.92 
 
 
529 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182452  normal  0.201851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1305  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  58.61 
 
 
529 aa  597  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.803573  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2666  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  55.56 
 
 
514 aa  588  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660733  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0974  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  57 
 
 
521 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1214  cytochrome bd-II oxidase, subunit I  55.56 
 
 
514 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1093  cytochrome bd-II oxidase, subunit I  55.56 
 
 
514 aa  589  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.209075  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1526  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit 1  54.98 
 
 
514 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.383883 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1082  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  57 
 
 
521 aa  589  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.410176  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2139  cytochrome bd-II oxidase, subunit I  55.56 
 
 
514 aa  589  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00988  hypothetical protein  55.56 
 
 
514 aa  588  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.660273  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1086  cytochrome bd-II oxidase, subunit I  55.56 
 
 
514 aa  588  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1934  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit I  54.98 
 
 
514 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2337  cytochrome bd-II oxidase, subunit I  55.36 
 
 
514 aa  588  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>