More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1058 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  55.08 
 
 		 192 aa  208  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  53.76 
 
 		 213 aa  201  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  53.19 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  52.66 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  51.06 
 
 		 230 aa  192  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  51.06 
 
 		 204 aa  190  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  51.63 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  51.27 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  49.2 
 
 		 213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  51.27 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02582  peptidyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 193 aa  187  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00538326  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  51.6 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  52.13 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  50.53 
 
 		 211 aa  185  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  50.53 
 
 		 211 aa  185  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0248  peptidyl-tRNA hydrolase  53.03 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0275  peptidyl-tRNA hydrolase  53.03 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.613029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  56.99 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  47.87 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0393  peptidyl-tRNA hydrolase  52.53 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4135  peptidyl-tRNA hydrolase  51.78 
 
 		 200 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  48.94 
 
 		 216 aa  177  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0071  peptidyl-tRNA hydrolase  55.14 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0313  peptidyl-tRNA hydrolase  51.27 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0583  peptidyl-tRNA hydrolase  50.76 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258134  normal  0.0303401 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0472  peptidyl-tRNA hydrolase  51.78 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0504  peptidyl-tRNA hydrolase  52.41 
 
 		 194 aa  175  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  48.66 
 
 		 194 aa  174  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2042  peptidyl-tRNA hydrolase  54.59 
 
 		 187 aa  174  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 194 aa  174  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0340  peptidyl-tRNA hydrolase  50.51 
 
 		 199 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6134  peptidyl-tRNA hydrolase  50.76 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.014975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2815  peptidyl-tRNA hydrolase  50.76 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490887  normal  0.867617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2190  peptidyl-tRNA hydrolase  49.75 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0999239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2804  peptidyl-tRNA hydrolase  49.75 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1500  peptidyl-tRNA hydrolase  51.78 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0751  peptidyl-tRNA hydrolase  51.78 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0583  peptidyl-tRNA hydrolase  51.78 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  49.2 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0567  peptidyl-tRNA hydrolase  51.78 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00595812  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2928  peptidyl-tRNA hydrolase  51.78 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0511  peptidyl-tRNA hydrolase  51.27 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1984  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0267905 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0294  peptidyl-tRNA hydrolase  44.68 
 
 		 193 aa  171  5e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  49.2 
 
 		 192 aa  171  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000106612  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2205  peptidyl-tRNA hydrolase  49.2 
 
 		 192 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2722  peptidyl-tRNA hydrolase  50.25 
 
 		 199 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.016718  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2864  peptidyl-tRNA hydrolase  50.25 
 
 		 199 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00616861  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2570  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 		 194 aa  170  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0287  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.854961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0347  peptidyl-tRNA hydrolase  52.69 
 
 		 203 aa  167  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2120  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0277037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0389  peptidyl-tRNA hydrolase  54.95 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0179253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61790  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0172217  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5322  peptidyl-tRNA hydrolase  53.48 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2074  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 196 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225311  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2186  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 206 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2467  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.988822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2413  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 		 195 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.943472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2064  peptidyl-tRNA hydrolase  52.94 
 
 		 195 aa  164  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1627  peptidyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 		 196 aa  164  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.660591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3629  peptidyl-tRNA hydrolase  52.69 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0785  peptidyl-tRNA hydrolase  47.62 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000418835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1053  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004208  peptidyl-tRNA hydrolase  47.09 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3606  peptidyl-tRNA hydrolase  48.92 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00295121  normal  0.0514505 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0909  aminoacyl-tRNA hydrolase  49.2 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01245  peptidyl-tRNA hydrolase  46.81 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2344  peptidyl-tRNA hydrolase  50.8 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1850  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 		 195 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239028  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01179  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2443  Aminoacyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0491513  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1309  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00563247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01189  hypothetical protein  51.34 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  normal  0.097849 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1685  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal  0.435145 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2422  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0426078 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1351  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0179847  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2578  peptidyl-tRNA hydrolase  48.39 
 
 		 189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3559  peptidyl-tRNA hydrolase  50.53 
 
 		 194 aa  161  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3134  peptidyl-tRNA hydrolase  48.66 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000686708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0720  peptidyl-tRNA hydrolase  49.2 
 
 		 194 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1761  peptidyl-tRNA hydrolase  45.21 
 
 		 196 aa  160  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000319671  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0754  peptidyl-tRNA hydrolase  49.2 
 
 		 194 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0285  peptidyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 197 aa  160  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1922  peptidyl-tRNA hydrolase  48.7 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0764  peptidyl-tRNA hydrolase  48.66 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1522  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0197498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4463  peptidyl-tRNA hydrolase  48.66 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3732  peptidyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.292366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2706  peptidyl-tRNA hydrolase  47.85 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41540  peptidyl-tRNA hydrolase  49.2 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1916  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 194 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.295058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1922  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 194 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1354  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 194 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00856454  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1980  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 194 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0660178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>