More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1051 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  100 
 
 
360 aa  740  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  67.22 
 
 
361 aa  516  1e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  67.22 
 
 
361 aa  516  1e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.99484e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  63.79 
 
 
363 aa  498  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  64.07 
 
 
360 aa  494  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  64.9 
 
 
360 aa  492  1e-138  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  66.57 
 
 
360 aa  494  1e-138  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  64.62 
 
 
360 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  66.57 
 
 
361 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  66.67 
 
 
361 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  64.07 
 
 
362 aa  488  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  64.07 
 
 
362 aa  488  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  64.62 
 
 
360 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  64.62 
 
 
363 aa  491  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  64.07 
 
 
360 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  66.3 
 
 
360 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  64.62 
 
 
360 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  67.13 
 
 
361 aa  481  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  64.07 
 
 
360 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  64.62 
 
 
360 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  64.9 
 
 
360 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  61.56 
 
 
362 aa  478  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  62.67 
 
 
363 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  8.15596e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  61 
 
 
362 aa  474  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  8.01734e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  64.62 
 
 
360 aa  475  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  62.12 
 
 
363 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  61.56 
 
 
360 aa  475  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  63.23 
 
 
361 aa  474  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  62.12 
 
 
361 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  62.67 
 
 
363 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  63.51 
 
 
360 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  60.72 
 
 
362 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  63.61 
 
 
362 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  62.95 
 
 
363 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  62.67 
 
 
363 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  63.51 
 
 
361 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  61.56 
 
 
361 aa  472  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  61.56 
 
 
363 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  61.56 
 
 
363 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  62.67 
 
 
363 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  4.10243e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  61.28 
 
 
363 aa  469  1e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  64.8 
 
 
360 aa  471  1e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  61.28 
 
 
363 aa  469  1e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  59.89 
 
 
362 aa  469  1e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  62.12 
 
 
361 aa  470  1e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  61.28 
 
 
363 aa  469  1e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 
361 aa  469  1e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41470  peptide chain release factor 1  64.07 
 
 
360 aa  466  1e-130  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  64.9 
 
 
360 aa  463  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.44623e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  64.9 
 
 
360 aa  463  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.10156e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  64.9 
 
 
360 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  3.0401e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  64.9 
 
 
360 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  6.08431e-07  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3552  peptide chain release factor 1  60.17 
 
 
362 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0245342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01186  peptide chain release factor 1  64.9 
 
 
360 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  64.9 
 
 
360 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  61.94 
 
 
360 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1913  peptide chain release factor 1  64.62 
 
 
360 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  64.9 
 
 
360 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1375  peptide chain release factor 1  64.9 
 
 
360 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.7097e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  64.9 
 
 
360 aa  463  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  6.71796e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1547  peptide chain release factor 1  64.62 
 
 
360 aa  461  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891695  normal  0.256018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0723  peptide chain release factor 1  59.61 
 
 
361 aa  458  1e-128  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.905014  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  59.61 
 
 
360 aa  459  1e-128  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  60.11 
 
 
361 aa  460  1e-128  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1363  peptide chain release factor 1  64.62 
 
 
360 aa  461  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.33324e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1907  peptide chain release factor 1  64.62 
 
 
360 aa  461  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0341026  normal  0.709349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1971  peptide chain release factor 1  64.62 
 
 
360 aa  461  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00228451  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  57.89 
 
 
364 aa  456  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  59.89 
 
 
360 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  60.72 
 
 
360 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2114  peptide chain release factor 1  64.9 
 
 
360 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2407  peptide chain release factor 1  65.46 
 
 
360 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  59.89 
 
 
356 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  59.61 
 
 
360 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  60.72 
 
 
360 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  60.72 
 
 
360 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 
360 aa  452  1e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 
360 aa  451  1e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  60.74 
 
 
355 aa  451  1e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  61.25 
 
 
355 aa  452  1e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 
361 aa  453  1e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 
360 aa  453  1e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2072  peptide chain release factor 1  63.23 
 
 
360 aa  451  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  59.83 
 
 
360 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  59.05 
 
 
360 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  59.83 
 
 
360 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0790  peptide chain release factor 1  57.66 
 
 
362 aa  449  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 
360 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  56.35 
 
 
362 aa  444  1e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  58.84 
 
 
360 aa  446  1e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  59.12 
 
 
360 aa  446  1e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  59.61 
 
 
360 aa  446  1e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  59.61 
 
 
360 aa  445  1e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  59.61 
 
 
360 aa  445  1e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  59.61 
 
 
360 aa  445  1e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  59.22 
 
 
360 aa  446  1e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  60.51 
 
 
356 aa  447  1e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 
360 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 
360 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 
360 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>