93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0930 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 296 aa  600  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  75.09 
 
 		 298 aa  441  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  58.7 
 
 		 294 aa  321  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  59.04 
 
 		 294 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  56.42 
 
 		 297 aa  311  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  58.8 
 
 		 293 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  57.64 
 
 		 291 aa  309  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  55.93 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.19 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.46 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.46 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.36 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  38.38 
 
 		 307 aa  178  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  36.63 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.26 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  39.64 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.27 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.13 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  41.11 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  38.18 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  38.18 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.96 
 
 		 313 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.45 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.43 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  37.45 
 
 		 305 aa  175  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.8 
 
 		 307 aa  175  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.16 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  38.27 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  37.77 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.09 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  37.55 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.36 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.81 
 
 		 320 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.81 
 
 		 320 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.35 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.46 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.46 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  36.36 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  36.1 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  36 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  36 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  38.18 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.26 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  40.83 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  34.84 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  35.79 
 
 		 320 aa  156  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.14 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  37.73 
 
 		 327 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  33.88 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  35.54 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  34.71 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  36.46 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  33.09 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  35.68 
 
 		 327 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  35.19 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.53 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  37.66 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  34.6 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.92 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  30.04 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.14 
 
 		 330 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.12 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.18 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  31.2 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  31.3 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  30.74 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  30.3 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  23.46 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  23.7 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  23.7 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  26.74 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.23 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.05 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.38 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  21.5 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  21.7 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.19 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  22.19 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.71 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  22.19 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  23 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.27 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.09 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.1 
 
 		 329 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.09 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.46 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  20.44 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  35.23 
 
 		 130 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1097  hypothetical cytosolic protein  22.86 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0582  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.76 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0780613  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2447  CRISPR-associated protein Cas1  21.2 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.43322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>