More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0866 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0866  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase family protein, putative  100 
 
 		 504 aa  1018    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0387  radical SAM domain-containing protein  56.6 
 
 		 552 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  0.247194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4256  radical SAM family protein  54.53 
 
 		 536 aa  567  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2424  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  50.4 
 
 		 551 aa  553  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4163  radical SAM family protein  53.97 
 
 		 524 aa  550  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0959  radical SAM family protein  54.46 
 
 		 530 aa  544  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3079  radical SAM family protein  54.46 
 
 		 530 aa  544  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.265778  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1018  Radical SAM domain protein  44.77 
 
 		 504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1571  Radical SAM domain protein  48.32 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.805269  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  46.33 
 
 		 502 aa  445  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1897  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 		 559 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1616  radical SAM domain-containing protein  29.88 
 
 		 559 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.710753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0197  radical SAM family protein  34.33 
 
 		 656 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1298  radical SAM domain-containing protein  36.59 
 
 		 600 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  32.13 
 
 		 590 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0840  cobalamin B12-binding domain protein  29.25 
 
 		 590 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3186  radical SAM family protein  31.06 
 
 		 583 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0494  Fe-S oxidoreductase  36.62 
 
 		 569 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  32.16 
 
 		 535 aa  227  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4724  Radical SAM domain protein  32.34 
 
 		 581 aa  226  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0614  radical SAM domain-containing protein  33.77 
 
 		 570 aa  226  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 557 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 		 557 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  30.17 
 
 		 584 aa  216  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  27.2 
 
 		 575 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0143  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 583 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 622 aa  153  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  30.71 
 
 		 609 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0101  radical SAM family protein  28.64 
 
 		 624 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00410532  normal  0.882418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0076  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 616 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.3742100000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0124  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 625 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0216543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0741  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 623 aa  127  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 490 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0273  radical SAM domain-containing protein  25.92 
 
 		 589 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3180  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 646 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 564 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2412  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 459 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2413  radical SAM domain-containing protein  28.94 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3233  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 531 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.53 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  26.4 
 
 		 563 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 625 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 564 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0095  radical SAM domain-containing protein  27.9 
 
 		 651 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.35 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  28.28 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  24.27 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  26.07 
 
 		 548 aa  69.3  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3488  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  24.32 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  22.94 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  27.47 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  25.56 
 
 		 864 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 529 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2166  radical SAM family Fe-S protein  26.14 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3713  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 669 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  34.29 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 520 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  21.86 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.01 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  25.83 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  20.36 
 
 		 566 aa  62  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 		 1288 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.35 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.89 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  24.2 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 487 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  22.93 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3467  Radical SAM domain protein  24.2 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  29.79 
 
 		 598 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  22.51 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.34 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.28 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  20.38 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  21.75 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.82 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.71 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3359  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 539 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>