More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0831 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  100 
 
 
752 aa  1456    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  42.77 
 
 
808 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  44.5 
 
 
789 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 
760 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  44.94 
 
 
793 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  46.01 
 
 
764 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  45.45 
 
 
764 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  45.73 
 
 
769 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  46.05 
 
 
755 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  46.78 
 
 
766 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  43.95 
 
 
768 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 
769 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  46.88 
 
 
769 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
769 aa  558  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 
769 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  45.65 
 
 
769 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  45.65 
 
 
769 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  45.47 
 
 
767 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  45.06 
 
 
765 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  45.06 
 
 
762 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  48.01 
 
 
896 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 
896 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 
804 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  43.49 
 
 
763 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  47.55 
 
 
864 aa  512  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  47.39 
 
 
864 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  47.55 
 
 
864 aa  512  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  47.55 
 
 
864 aa  512  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  47.1 
 
 
832 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  47.55 
 
 
864 aa  512  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  47.39 
 
 
864 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  48.97 
 
 
1079 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
741 aa  343  5.999999999999999e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
762 aa  340  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
742 aa  339  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
679 aa  336  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
783 aa  335  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
679 aa  334  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
740 aa  330  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
686 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  38.63 
 
 
878 aa  327  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.18 
 
 
734 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
772 aa  321  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
781 aa  318  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.41 
 
 
769 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
777 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  28.96 
 
 
769 aa  312  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  28.8 
 
 
769 aa  310  6.999999999999999e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  31.56 
 
 
1987 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 
784 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
801 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.35 
 
 
1992 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
758 aa  303  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  30.82 
 
 
764 aa  301  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  30.03 
 
 
774 aa  300  9e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  29.57 
 
 
798 aa  299  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  27.92 
 
 
770 aa  296  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  32.77 
 
 
2458 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
1647 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
1646 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
1646 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 
1629 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  28.66 
 
 
2336 aa  289  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
2212 aa  289  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
777 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
1065 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  30.65 
 
 
770 aa  288  2.9999999999999996e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  35.67 
 
 
2476 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
2423 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
1609 aa  283  9e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
753 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
865 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
865 aa  280  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
756 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  30.39 
 
 
764 aa  278  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
756 aa  277  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.54 
 
 
1971 aa  277  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
750 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.16 
 
 
839 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  30.04 
 
 
2301 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  28.19 
 
 
2301 aa  274  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.04 
 
 
785 aa  273  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.63 
 
 
1960 aa  271  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
2539 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
695 aa  271  4e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
707 aa  267  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
989 aa  267  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
989 aa  266  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 
1907 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
706 aa  266  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
770 aa  265  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
1127 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
777 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
1725 aa  263  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
598 aa  263  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
1725 aa  262  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
1832 aa  262  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6787  CheA signal transduction histidine kinase  31 
 
 
790 aa  261  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  0.39723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
974 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  27.53 
 
 
2284 aa  260  6e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>