More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0778 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  100 
 
 
439 aa  881    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.71 
 
 
466 aa  229  7e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  34.33 
 
 
486 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
468 aa  186  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
471 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.33 
 
 
448 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  32.1 
 
 
490 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
472 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4916  histidine kinase  35.57 
 
 
509 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.69179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4452  ATPase domain-containing protein  34.9 
 
 
509 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
453 aa  160  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  31.18 
 
 
477 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
493 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
496 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
506 aa  153  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0306012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  37.35 
 
 
521 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  30.37 
 
 
475 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  33.33 
 
 
453 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
476 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  33.33 
 
 
478 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  32.58 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
424 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1905  putative signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
493 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0907492  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  38.46 
 
 
466 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
439 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
560 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1029  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  28.47 
 
 
462 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  28.57 
 
 
468 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
424 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
336 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  29.3 
 
 
459 aa  133  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3467  putative signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
446 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.548069  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  39.32 
 
 
515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1786  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.03 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663112  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  38.6 
 
 
598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
595 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2604  signal transduction histidine kinase glucose-6-phosphate-like protein  28.78 
 
 
495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
594 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  36.39 
 
 
488 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
596 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 
468 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0029863  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  32.48 
 
 
489 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  37.76 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3269  ATPase domain-containing protein  31.18 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329893  normal  0.409282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  34.03 
 
 
619 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
684 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  34.03 
 
 
680 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
707 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  34.03 
 
 
680 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
475 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  35.38 
 
 
683 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  35.62 
 
 
1046 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
700 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  34.07 
 
 
710 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  34.07 
 
 
710 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  32.37 
 
 
687 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  32.52 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  37.45 
 
 
458 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  34.38 
 
 
325 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
366 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
1168 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
700 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
700 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
703 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
700 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
665 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  30.49 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
526 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  36.53 
 
 
313 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
703 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  36.24 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
1229 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
541 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  33.93 
 
 
575 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  33.93 
 
 
575 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
541 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  33.93 
 
 
575 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  32.79 
 
 
1226 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  33.93 
 
 
740 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
384 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
370 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
748 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
692 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
359 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0477  two-component sensor histidine kinase  30.55 
 
 
488 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
513 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>