More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0775 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0775  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  100 
 
 
342 aa  687    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1084  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.22 
 
 
342 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31  normal  0.438887 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0630  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  54.25 
 
 
344 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.69 
 
 
348 aa  276  5e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2709  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.31 
 
 
334 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0343  alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 
333 aa  266  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1330  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  42.98 
 
 
380 aa  265  7e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1192  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.45 
 
 
332 aa  262  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.08 
 
 
332 aa  260  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.46 
 
 
329 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0573  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.91 
 
 
330 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.526868  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11890  alcohol dehydrogenase adhA  44.8 
 
 
346 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.594038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3073  alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 
333 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1418  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.75 
 
 
327 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0046  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  44.55 
 
 
336 aa  255  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6316  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  42.47 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0303  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.23 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.16 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3343  alcohol dehydrogenase  45.75 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0866379 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2442  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.16 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1844  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.17 
 
 
328 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.364019  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0116  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.62 
 
 
327 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0829  alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
332 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0138  alcohol dehydrogenase  43.31 
 
 
337 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1412  alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 
338 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4103  putative alcohol dehydrogenase  47.49 
 
 
332 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.409258  normal  0.240324 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2413  hypothetical protein  40.87 
 
 
328 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.55 
 
 
323 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3850  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  42.17 
 
 
324 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2558  hypothetical protein  39.59 
 
 
328 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00880  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  44.74 
 
 
327 aa  245  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4206  alcohol dehydrogenase  45.16 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773596  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1061  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.4 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215754  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1026  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.4 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2022  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.76 
 
 
332 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000478739  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5774  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.57 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4482  alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5710  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  40.91 
 
 
328 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4279  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.52 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3003  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.86 
 
 
347 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6571  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  41.16 
 
 
358 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4710  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.86 
 
 
331 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5905  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.52 
 
 
329 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.22496 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3811  alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.367901  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0459  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.11 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0264  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.54 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0378  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.21 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2010  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  42.42 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0778  alcohol dehydrogenase  39.83 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0909  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.82 
 
 
328 aa  232  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.543563  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  39.88 
 
 
335 aa  232  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0255685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2088  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  39.88 
 
 
335 aa  232  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1096  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.86 
 
 
338 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1113  alcohol dehydrogenase  43.86 
 
 
338 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1124  alcohol dehydrogenase  43.86 
 
 
338 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1118  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  42.6 
 
 
329 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.439125 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2748  putative oxidoreductase  42.73 
 
 
328 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.61 
 
 
344 aa  229  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0163  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.23 
 
 
328 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1018  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.23 
 
 
328 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0189  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.23 
 
 
328 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2605  putative oxidoreductase  42.23 
 
 
328 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1333  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.23 
 
 
328 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.23 
 
 
332 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1805  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  43.07 
 
 
332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1201  putative alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  40.73 
 
 
329 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478337  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  40.81 
 
 
336 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3411  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.14 
 
 
341 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0749603  normal  0.0972256 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  40.81 
 
 
336 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4129  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  42.52 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140099 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3463  alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 
334 aa  219  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2263  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.59 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2296  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  42.44 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2299  alcohol dehydrogenase  40.57 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5373  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.21 
 
 
331 aa  212  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.31 
 
 
338 aa  210  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1505  alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  39.94 
 
 
334 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1916  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.67 
 
 
327 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5755  putative alcohol dehydrogenase  39.7 
 
 
329 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667662  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  42.81 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185569  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0426  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  38.17 
 
 
327 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2614  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  38.49 
 
 
327 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6106  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  42.37 
 
 
326 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.14 
 
 
304 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5387  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.49 
 
 
326 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 
336 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
338 aa  169  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0181  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase (ADH-HT). oxidoreductase protein  45.51 
 
 
188 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.103574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1193  alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.63 
 
 
335 aa  163  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.16 
 
 
340 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.6 
 
 
337 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  31.14 
 
 
341 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  45.35 
 
 
340 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  29.89 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  38.5 
 
 
342 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 
341 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.03 
 
 
342 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  38.03 
 
 
342 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>