52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0744 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  359  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  31.33 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  28.85 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  26.75 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  25.48 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  34.74 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  28.66 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  33.68 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  26.4 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  26.4 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  27.78 
 
 		 229 aa  51.2  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  26.92 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03190  hypothetical protein  25.71 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  26.28 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  25.6 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  25.97 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0955  hypothetical protein  26.14 
 
 		 190 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  26 
 
 		 190 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  23.31 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  31.58 
 
 		 204 aa  47.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  32.63 
 
 		 204 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  23.18 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  26.06 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  31.58 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  31.58 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  31.58 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1174  hypothetical protein  26.19 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  23.18 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  30.97 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4260  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  23.7 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  30.77 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  30.77 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  33.7 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  26.92 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  26.92 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  22.45 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  23.91 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  32.61 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  32.61 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  32.61 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  27.06 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  24.04 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  24.04 
 
 		 186 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  24.04 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  24.04 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  31.52 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  31.52 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  31.52 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  31.52 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  40.8  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>