More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0592 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2849  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  64.13 
 
 
820 aa  1080    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.924378  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1667  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  56.2 
 
 
810 aa  886    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0751233  normal  0.158912 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1990  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  45.35 
 
 
801 aa  734    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0592  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  100 
 
 
820 aa  1687    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1629  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  57.59 
 
 
816 aa  967    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.899619  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2177  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  48.36 
 
 
801 aa  764    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1997  nitrite reductase  48.24 
 
 
801 aa  763    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00110354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1970  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  48.36 
 
 
801 aa  765    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.473081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1949  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  48.24 
 
 
801 aa  762    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0412209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3130  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  65.31 
 
 
814 aa  1108    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  62.56 
 
 
821 aa  1060    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0816  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  64.21 
 
 
814 aa  1100    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.359061  normal  0.0137371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3528  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  64.13 
 
 
820 aa  1080    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2309  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  67.78 
 
 
818 aa  1135    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0719  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  56.81 
 
 
820 aa  918    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.825422  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0741  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  65.19 
 
 
814 aa  1103    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1781  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  62.38 
 
 
823 aa  1056    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2839  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  61.95 
 
 
821 aa  1033    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.184658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2096  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  62.65 
 
 
818 aa  1070    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1080  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  55.53 
 
 
814 aa  930    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.406718  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2678  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  55.74 
 
 
808 aa  878    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  57.46 
 
 
816 aa  970    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116537  normal  0.910407 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2146  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  48.24 
 
 
801 aa  763    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243171  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3242  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.59 
 
 
819 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838736  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1490  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  65.31 
 
 
814 aa  1108    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0464  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  65.68 
 
 
814 aa  1110    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  61.83 
 
 
821 aa  1031    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0397  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.22 
 
 
834 aa  635    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17666  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2968  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  62.27 
 
 
831 aa  1016    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205655  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3043  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  55.31 
 
 
811 aa  897    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301958  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0573  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  65.07 
 
 
814 aa  1102    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2557  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  61.03 
 
 
823 aa  1054    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323031  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1707  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  60.89 
 
 
839 aa  1016    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3276  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  63.79 
 
 
810 aa  1058    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464677  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1114  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  66.09 
 
 
812 aa  1140    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2593  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  60.39 
 
 
825 aa  1014    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2293  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  48.24 
 
 
801 aa  764    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1990  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  47.67 
 
 
800 aa  756    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2965  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  61.26 
 
 
817 aa  993    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3774  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.89 
 
 
813 aa  654    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.541337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1142  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  64.56 
 
 
825 aa  1089    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.861226  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23370  Assimilatory Nitrite reductase,large subunit; NasA  62.01 
 
 
816 aa  1031    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1266  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  61.01 
 
 
825 aa  1012    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0963412  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0099  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  65.31 
 
 
814 aa  1108    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3525  assimilatory nitrite reductase large subunit  62.64 
 
 
816 aa  1060    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2152  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  48.49 
 
 
801 aa  767    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.57135  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3231  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  45.71 
 
 
819 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  57.27 
 
 
814 aa  924    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2424  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.6 
 
 
801 aa  754    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1407  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  60.38 
 
 
815 aa  1014    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1000  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  62.68 
 
 
816 aa  1077    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2107  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  61.15 
 
 
823 aa  1020    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.614083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1700  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  67.33 
 
 
811 aa  1137    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.575793 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3162  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  48.05 
 
 
801 aa  761    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00213461  normal  0.298002 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2472  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46.6 
 
 
801 aa  754    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0668  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  71.66 
 
 
826 aa  1217    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41530  assimilatory nitrite reductase large subunit  62.64 
 
 
816 aa  1065    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2956  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  58.85 
 
 
818 aa  981    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3275  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.17 
 
 
846 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0558  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  65.44 
 
 
814 aa  1108    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840641  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2317  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  63.99 
 
 
819 aa  1080    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.551763  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4452  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.22 
 
 
810 aa  900    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5894  nitrite reductase large subunit  58.46 
 
 
815 aa  988    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0208  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  49.5 
 
 
801 aa  778    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2919  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  65.31 
 
 
814 aa  1108    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3293  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.71 
 
 
819 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.192884 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4525  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  58.3 
 
 
820 aa  981    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.927735  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.85 
 
 
822 aa  635    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742948  normal  0.535106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3053  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.9 
 
 
827 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.050716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2245  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.99 
 
 
837 aa  628  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.131347  normal  0.240706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1392  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.69 
 
 
839 aa  623  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.79174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.27 
 
 
870 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0740855  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3013  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.38 
 
 
823 aa  611  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.190459 
 
 
-
 
NC_003296  RS03164  flavoprotein FAD oxidoreductase  66.83 
 
 
409 aa  555  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229065  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67 
 
 
410 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4166  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67 
 
 
410 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4862  assimilatory nitrate reductase (NADH) beta subunit  65.91 
 
 
413 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4820  assimilatory nitrate reductase (NADH) small subunit  65.91 
 
 
413 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0713443  normal  0.685908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2302  assimilatory nitrate reductase electron transfer subunit domain protein  66 
 
 
409 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0640092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.25 
 
 
409 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.856464  hitchhiker  0.00707192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1332  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  39.3 
 
 
837 aa  528  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0149274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2371  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.9 
 
 
426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5406  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.43 
 
 
837 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.51 
 
 
1373 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05591  nitrate reductase  37.79 
 
 
839 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2879  nitrite reductase (NAD(P)H)subunit  36.86 
 
 
971 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2384  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  36.54 
 
 
830 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312411  normal  0.440122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1441  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.51 
 
 
1386 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281756  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3716  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  39.54 
 
 
861 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2322  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor / assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit / assimilatory nitrate reductase (NADH) beta subunit  39.16 
 
 
1328 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286672  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2355  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  37.59 
 
 
851 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000467029  normal  0.479007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.76 
 
 
837 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2176  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  40.64 
 
 
833 aa  472  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000870313  hitchhiker  0.00000985708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2412  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  40.24 
 
 
846 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000434604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4260  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  40.25 
 
 
837 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00961758  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5924  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  39.35 
 
 
814 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0194616  normal  0.0886236 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2730  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.83 
 
 
1396 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2906  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.55 
 
 
1381 aa  465  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  36.98 
 
 
850 aa  462  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0245  nitrite reductase large subunit  37.6 
 
 
858 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>