More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0550 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0550  DNA methyltransferase  100 
 
 		 1192 aa  2444    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0608509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4081  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  64.56 
 
 		 1103 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0241  DNA methylase N-4/N-6  50.84 
 
 		 939 aa  490  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4172  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50.6 
 
 		 972 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50.98 
 
 		 884 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2856  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.75 
 
 		 938 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0200  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  49.38 
 
 		 896 aa  432  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1466  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.62 
 
 		 906 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  44.3 
 
 		 849 aa  152  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0197  hypothetical protein  29.87 
 
 		 646 aa  147  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.2 
 
 		 644 aa  138  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0547  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.77 
 
 		 752 aa  137  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392041  normal  0.581045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1491  adenine specific DNA-methyltransferase  28.24 
 
 		 779 aa  134  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00364069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0436  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.92 
 
 		 696 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.231086  normal  0.907553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0029  hypothetical protein  52.5 
 
 		 128 aa  124  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3954  hypothetical protein  51.11 
 
 		 162 aa  124  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal  0.657782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1188  hypothetical protein  46.72 
 
 		 124 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2706  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.03 
 
 		 438 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1525  hypothetical protein  51.38 
 
 		 111 aa  122  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01266  hypothetical protein  49.17 
 
 		 117 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2357  protein of unknown function DUF559  49.17 
 
 		 117 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2336  hypothetical protein  49.17 
 
 		 117 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01277  hypothetical protein  49.17 
 
 		 117 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2348  hypothetical protein  55.24 
 
 		 141 aa  121  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1496  hypothetical protein  48.33 
 
 		 116 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.668416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1403  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  118  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0860159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1572  hypothetical protein  42.48 
 
 		 161 aa  117  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.62267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51690  hypothetical protein  51.67 
 
 		 120 aa  117  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00189742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1569  hypothetical protein  57 
 
 		 123 aa  116  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0914412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1700  hypothetical protein  57 
 
 		 123 aa  116  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.768881  normal  0.131278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0676  DNA methylase N-4/N-6  28.91 
 
 		 520 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.635951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0163  hypothetical protein  43.06 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103977  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0701  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  112  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1869  hypothetical protein  50.98 
 
 		 111 aa  112  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1774  hypothetical protein  45.77 
 
 		 146 aa  112  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1037  hypothetical protein  56.67 
 
 		 120 aa  111  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252748 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0936  adenine specific DNA methylase MOD  26.71 
 
 		 577 aa  111  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000403504  normal  0.65434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3456  hypothetical protein  49.63 
 
 		 175 aa  111  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24470  adinene-specific DNA-methyltransferase  30.1 
 
 		 677 aa  110  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0655  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.08 
 
 		 442 aa  111  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000525307  normal  0.106062 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0562  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  110  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  36.6 
 
 		 1279 aa  110  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0683  hypothetical protein  48.15 
 
 		 116 aa  108  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4152  DNA methylase N-4/N-6  24.12 
 
 		 544 aa  108  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.62 
 
 		 545 aa  108  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4935  protein of unknown function DUF559  55.1 
 
 		 122 aa  108  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0533861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3609  hypothetical protein  35.87 
 
 		 201 aa  108  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.239567  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1553  hypothetical protein  56.12 
 
 		 117 aa  108  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.672305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0037  protein of unknown function DUF559  50 
 
 		 159 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1229  hypothetical protein  42.11 
 
 		 159 aa  107  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.53 
 
 		 553 aa  107  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2461  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  43.84 
 
 		 1403 aa  106  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0003  hypothetical protein  49.56 
 
 		 123 aa  107  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3323  DNA methylase  27.53 
 
 		 542 aa  107  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.622136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5447  protein of unknown function DUF559  41.13 
 
 		 137 aa  107  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1037  protein of unknown function DUF559  49.55 
 
 		 122 aa  105  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3525  hypothetical protein  48.57 
 
 		 123 aa  105  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.739621  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0405  hypothetical protein  52.04 
 
 		 131 aa  105  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1705  hypothetical protein  40.51 
 
 		 1421 aa  105  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1220  hypothetical protein  43.26 
 
 		 144 aa  104  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0966  hypothetical protein  48.7 
 
 		 137 aa  104  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4286  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.8 
 
 		 447 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1094  hypothetical protein  41.26 
 
 		 144 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.090836  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52350  adenine specific DNA methylase N-4/N-6  25.05 
 
 		 560 aa  103  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0541  hypothetical protein  38.92 
 
 		 225 aa  102  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.164679  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1681  protein of unknown function DUF559  45.1 
 
 		 117 aa  102  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0164  protein of unknown function DUF559  51.58 
 
 		 119 aa  102  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0813  protein of unknown function DUF559  42.52 
 
 		 139 aa  101  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3620  protein of unknown function DUF559  45.6 
 
 		 142 aa  101  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0237  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.34 
 
 		 626 aa  101  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1674  protein of unknown function DUF559  44 
 
 		 133 aa  101  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1238  protein of unknown function DUF559  42.86 
 
 		 144 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0011  protein of unknown function DUF559  45.38 
 
 		 123 aa  100  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1355  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.63 
 
 		 378 aa  100  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0685753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4096  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.69 
 
 		 545 aa  100  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.480555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0213  hypothetical protein  43.75 
 
 		 139 aa  100  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0731  type III restriction/modification enzyme, methylase subunit  23.83 
 
 		 675 aa  99.8  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1578  hypothetical protein  47.52 
 
 		 111 aa  99.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2952  hypothetical protein  47.52 
 
 		 111 aa  99.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0546  hypothetical protein  45.76 
 
 		 123 aa  99.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  0.680217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2808  hypothetical protein  45.07 
 
 		 141 aa  99.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.446189  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2356  hypothetical protein  45.37 
 
 		 142 aa  99.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0831458  normal  0.14274 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1236  hypothetical protein  39.41 
 
 		 175 aa  99.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.453512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0022  protein of unknown function DUF559  44.07 
 
 		 123 aa  98.6  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0046  hypothetical protein  44.7 
 
 		 163 aa  98.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0869  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.07 
 
 		 505 aa  98.2  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.49 
 
 		 599 aa  98.2  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  23.49 
 
 		 599 aa  98.2  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1980  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.17 
 
 		 547 aa  97.8  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1559  hypothetical protein  52.08 
 
 		 121 aa  97.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0647  hypothetical protein  45.54 
 
 		 138 aa  97.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2473  protein of unknown function DUF559  52.22 
 
 		 121 aa  96.3  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0851  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.6 
 
 		 586 aa  96.3  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2534  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  95.9  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.984532  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0838  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  35.52 
 
 		 459 aa  95.5  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2495  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.98 
 
 		 601 aa  95.5  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0433  hypothetical protein  44.54 
 
 		 132 aa  95.1  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0580  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.35 
 
 		 629 aa  94.7  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1369  hypothetical protein  45.22 
 
 		 175 aa  94.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.628827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2722  hypothetical protein  46.3 
 
 		 147 aa  93.2  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>