More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0542 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  100 
 
 
606 aa  1211  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2127  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  54.14 
 
 
605 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.41 
 
 
625 aa  362  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.92 
 
 
628 aa  351  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.6 
 
 
619 aa  350  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.97 
 
 
619 aa  349  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.32 
 
 
625 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.66 
 
 
633 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.97095e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.6 
 
 
634 aa  342  8e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.28 
 
 
633 aa  343  8e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.26358e-07  unclonable  6.28543e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.12 
 
 
633 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.33092e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.12 
 
 
633 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.12 
 
 
633 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.07333e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  33.12 
 
 
633 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.74005e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  33.12 
 
 
633 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.00713e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.12 
 
 
633 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.60892e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.12 
 
 
633 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  7.47097e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.12 
 
 
633 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  37.03 
 
 
643 aa  336  6e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.9 
 
 
605 aa  335  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.28708e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.26 
 
 
635 aa  334  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2937  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  40.24 
 
 
586 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0596  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.33 
 
 
630 aa  329  1e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.96 
 
 
632 aa  327  4e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  2.88023e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.11 
 
 
629 aa  323  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.84 
 
 
629 aa  322  2e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.02 
 
 
631 aa  319  8e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.11 
 
 
629 aa  319  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.19 
 
 
638 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0265  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.31 
 
 
581 aa  316  7e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35 
 
 
622 aa  315  2e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.56 
 
 
637 aa  314  3e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.51 
 
 
633 aa  313  8e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.17 
 
 
635 aa  313  8e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3272  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  34.43 
 
 
642 aa  313  9e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.95 
 
 
646 aa  310  3e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.37 
 
 
643 aa  310  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.09 
 
 
631 aa  310  6e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  30.82 
 
 
629 aa  308  2e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  30.68 
 
 
630 aa  307  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.62 
 
 
666 aa  308  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2387  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.9 
 
 
655 aa  307  4e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3421  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.9 
 
 
662 aa  306  9e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.26 
 
 
641 aa  305  1e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.7 
 
 
634 aa  306  1e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.71 
 
 
639 aa  305  2e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.42 
 
 
641 aa  303  5e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3348  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.21 
 
 
643 aa  302  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.08 
 
 
647 aa  302  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.85 
 
 
623 aa  301  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3256  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.39 
 
 
634 aa  300  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00445489  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.29 
 
 
676 aa  300  7e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.465909  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.77 
 
 
632 aa  300  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0230  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.4 
 
 
658 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.69 
 
 
610 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.41 
 
 
678 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.22 
 
 
649 aa  297  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4439  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.69 
 
 
634 aa  296  9e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.16 
 
 
629 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.59 
 
 
633 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2615  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.25 
 
 
637 aa  295  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.665641  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.86 
 
 
632 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0793  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.33 
 
 
639 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.716028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3049  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.86 
 
 
643 aa  294  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.524302  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2956  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.06 
 
 
678 aa  293  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1053  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.72 
 
 
649 aa  293  8e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  1.22454e-06  hitchhiker  0.00273706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1366  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.48 
 
 
642 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2276  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.01 
 
 
601 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315443  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.99 
 
 
664 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.32 
 
 
627 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.98 
 
 
678 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7206  putative asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  37.22 
 
 
569 aa  289  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2948  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.37 
 
 
614 aa  288  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.45 
 
 
637 aa  287  3e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.79 
 
 
666 aa  287  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.49 
 
 
660 aa  286  6e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  32.09 
 
 
637 aa  285  1e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4066  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.45 
 
 
601 aa  284  3e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.68 
 
 
653 aa  284  3e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.122782 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1617  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.66 
 
 
583 aa  284  3e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2533  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.24 
 
 
625 aa  283  5e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.7 
 
 
660 aa  283  7e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.86 
 
 
596 aa  283  8e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2541  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.33 
 
 
621 aa  283  8e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  0.489677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3283  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.8 
 
 
653 aa  282  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524928  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  35.91 
 
 
594 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3607  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.19 
 
 
615 aa  282  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10620  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  35.32 
 
 
642 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.295992 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0474  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.61 
 
 
628 aa  281  3e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3188  asparagine synthase amidotransferase  35.5 
 
 
589 aa  281  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.85 
 
 
602 aa  280  5e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3062  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.18 
 
 
646 aa  280  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.17 
 
 
595 aa  280  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.2 
 
 
645 aa  279  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.88 
 
 
601 aa  280  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994358  normal  0.105785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.88 
 
 
601 aa  280  8e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2055  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.88 
 
 
601 aa  280  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559869  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2789  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.83 
 
 
670 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0135  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.77 
 
 
649 aa  278  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.1713e-05  normal  0.012193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  36.23 
 
 
590 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>