More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0496 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  61.79 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.54 
 
 		 301 aa  301  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  51.83 
 
 		 300 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  52.16 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  49.66 
 
 		 301 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  48 
 
 		 301 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  50 
 
 		 304 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49 
 
 		 302 aa  285  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  49 
 
 		 302 aa  285  9e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  49 
 
 		 302 aa  285  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  49.66 
 
 		 297 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.33 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  49.66 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  49.66 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  49.66 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  49.66 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  47.67 
 
 		 301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  49.33 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  49.33 
 
 		 297 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  53.12 
 
 		 305 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  48.99 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  48.32 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  47 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  47 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  49.16 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  47.33 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  47 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  47.33 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  53.18 
 
 		 305 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.83 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  49.33 
 
 		 295 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  47.65 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  50.5 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.51 
 
 		 301 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  47.65 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  47.65 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  47.65 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  47.65 
 
 		 297 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  43.24 
 
 		 297 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  43.58 
 
 		 297 aa  269  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.67 
 
 		 307 aa  268  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.634966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.16 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  45.24 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  43.23 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  47.49 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  47.49 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  43.84 
 
 		 294 aa  261  6.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  47 
 
 		 296 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0743  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.5 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  46.75 
 
 		 309 aa  259  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41380  sugar nucleotide epimerase  52.33 
 
 		 317 aa  258  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  44.82 
 
 		 296 aa  258  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.5 
 
 		 301 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  48.33 
 
 		 499 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  48.33 
 
 		 499 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  48.33 
 
 		 499 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  50.67 
 
 		 298 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  51.32 
 
 		 295 aa  255  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  44.12 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  46.69 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  41.72 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  45.76 
 
 		 499 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  44 
 
 		 301 aa  249  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  43.71 
 
 		 304 aa  248  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  41.64 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  45.82 
 
 		 298 aa  246  4e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  43.83 
 
 		 306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  42.02 
 
 		 306 aa  245  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  46.6 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.33 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  41.37 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  44.59 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  48.03 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  45.6 
 
 		 311 aa  242  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  40.39 
 
 		 306 aa  240  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.57 
 
 		 304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  40.98 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  40.98 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  46.71 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  41.67 
 
 		 316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  42.71 
 
 		 464 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  39.23 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  43.38 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  43.56 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3849  hypothetical protein  46.67 
 
 		 489 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  38.83 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  43.67 
 
 		 298 aa  229  6e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  40.46 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  44.33 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  47.14 
 
 		 478 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  38.03 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  42.53 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  37.86 
 
 		 309 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  43.33 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  38.44 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  38.19 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  40.13 
 
 		 312 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  41.4 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  44.41 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>