286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0477 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  100 
 
 
330 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  40.8 
 
 
329 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  41.41 
 
 
329 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  41.1 
 
 
329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  39.26 
 
 
329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  40.49 
 
 
329 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  40 
 
 
329 aa  252  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  41.42 
 
 
320 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  41.42 
 
 
320 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  39.88 
 
 
329 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  40.37 
 
 
329 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  39.26 
 
 
329 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  38.39 
 
 
328 aa  235  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  45.6 
 
 
317 aa  232  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  42.77 
 
 
323 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  46.39 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  40.07 
 
 
365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  40.06 
 
 
349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  40.06 
 
 
348 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  43.56 
 
 
310 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  40.53 
 
 
350 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  39.94 
 
 
350 aa  208  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  38.56 
 
 
389 aa  206  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  41.78 
 
 
309 aa  205  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  38.71 
 
 
350 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  41.49 
 
 
355 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  40 
 
 
310 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  36.88 
 
 
343 aa  202  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  40.95 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  40.96 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  41.12 
 
 
339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  39.52 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  39.52 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  39.52 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  42.18 
 
 
309 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  34.89 
 
 
334 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  37.66 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  39.38 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  42.19 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  39.82 
 
 
355 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  39.26 
 
 
353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  39.46 
 
 
356 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.75 
 
 
316 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  38.75 
 
 
316 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4360  allophanate hydrolase subunit 2  40.19 
 
 
312 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  41.5 
 
 
356 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.44 
 
 
316 aa  192  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  38.76 
 
 
359 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  38.76 
 
 
371 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  38.76 
 
 
359 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  38.76 
 
 
371 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  38.76 
 
 
371 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  38.76 
 
 
371 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  43.4 
 
 
301 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  38.46 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  40.47 
 
 
314 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  35.67 
 
 
322 aa  188  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  43.09 
 
 
345 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  41.64 
 
 
344 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  35.15 
 
 
325 aa  185  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  39.13 
 
 
310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  40.06 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  42.18 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  39.61 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  40.06 
 
 
323 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  36.03 
 
 
306 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  34.33 
 
 
334 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  38.21 
 
 
325 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  37.62 
 
 
353 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  36.84 
 
 
310 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  37.9 
 
 
359 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4581  urea amidolyase related protein  38.25 
 
 
338 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625746  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2955  urea amidolyase related protein  38.27 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  38.18 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  40.79 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  35.62 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  37.77 
 
 
331 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  37.91 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  36.36 
 
 
319 aa  179  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  38.61 
 
 
310 aa  178  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  36.12 
 
 
324 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6284  allophanate hydrolase  37.35 
 
 
331 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331947  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  39.42 
 
 
323 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  42.67 
 
 
304 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.709139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  38.61 
 
 
310 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  38.61 
 
 
310 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.92 
 
 
325 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  38.61 
 
 
310 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  38.8 
 
 
326 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.61 
 
 
310 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  38.19 
 
 
315 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  38.23 
 
 
323 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  38.61 
 
 
310 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  34.02 
 
 
329 aa  176  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  40.36 
 
 
329 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0378  urea amidolyase-related protein  33.43 
 
 
334 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  37.85 
 
 
310 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.85 
 
 
310 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>