225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0476 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  51.19 
 
 		 252 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  53.63 
 
 		 251 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  56.63 
 
 		 274 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  54.76 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  57.94 
 
 		 256 aa  270  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  56.4 
 
 		 256 aa  265  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  51.61 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  55.06 
 
 		 255 aa  261  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  47.64 
 
 		 255 aa  261  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  54.25 
 
 		 245 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  54.25 
 
 		 245 aa  259  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  54.25 
 
 		 245 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  56.68 
 
 		 244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1138  LamB/YcsF family protein  55.82 
 
 		 245 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  56.28 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  55.06 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  56.28 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  48 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  56.28 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  56.28 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  46.88 
 
 		 257 aa  256  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  55.87 
 
 		 244 aa  255  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  55.87 
 
 		 244 aa  255  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 253 aa  255  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 253 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  55.47 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  55.47 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  55.24 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  54.03 
 
 		 246 aa  252  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  54.84 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  53.44 
 
 		 246 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  51 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  52.61 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  46.94 
 
 		 254 aa  250  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  45.06 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  55.06 
 
 		 247 aa  248  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  51.39 
 
 		 254 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  53.85 
 
 		 245 aa  248  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  53.63 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  53.44 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  51 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0761  LamB/YcsF family protein  53.23 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  46.09 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0774  LamB/YcsF family protein  52.82 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.846244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  52.82 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  53.85 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0837  LamB/YcsF family protein  52.82 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610355 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  55.28 
 
 		 251 aa  242  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1228  LamB/YcsF family protein  53.04 
 
 		 245 aa  241  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  53.57 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  53.04 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2920  LamB/YcsF family protein  54.62 
 
 		 245 aa  238  8e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  51.97 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  51.57 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  54.13 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  51.57 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  51.57 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  51.57 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  51.42 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  51 
 
 		 250 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  51 
 
 		 250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  51.18 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  51.18 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  48.52 
 
 		 256 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  51.82 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 		 274 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 		 274 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  46.12 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  52.23 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  51.64 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  51.81 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  51.81 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  51.81 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  54.39 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  50.8 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  48.46 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  51.81 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  51.23 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  51.84 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>