More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0468 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  100 
 
 
303 aa  608  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  64.9 
 
 
303 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.26 
 
 
331 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  63.4 
 
 
306 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  65.45 
 
 
315 aa  360  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  59.08 
 
 
302 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.33 
 
 
306 aa  349  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  65.67 
 
 
315 aa  347  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  58.47 
 
 
315 aa  345  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  56.67 
 
 
306 aa  338  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.71 
 
 
300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  57.58 
 
 
306 aa  335  5e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  56.58 
 
 
306 aa  333  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  56.23 
 
 
306 aa  332  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  58.39 
 
 
306 aa  330  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  60.94 
 
 
305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  60.94 
 
 
305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  56.54 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  60.95 
 
 
308 aa  325  5e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  55.83 
 
 
303 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  56.04 
 
 
306 aa  323  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  59.21 
 
 
315 aa  322  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  61.22 
 
 
305 aa  321  7e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  57.34 
 
 
303 aa  322  7e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  59.44 
 
 
317 aa  322  7e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  59.12 
 
 
306 aa  321  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  56.45 
 
 
303 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.52 
 
 
317 aa  320  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.9 
 
 
306 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  56.9 
 
 
306 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  57.34 
 
 
303 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  59.09 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  58.94 
 
 
317 aa  318  5e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  59.04 
 
 
308 aa  318  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  55.24 
 
 
303 aa  318  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  57.43 
 
 
305 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  54.98 
 
 
303 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  57.04 
 
 
304 aa  316  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  57.6 
 
 
303 aa  316  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  59.12 
 
 
305 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.24 
 
 
303 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  59.46 
 
 
305 aa  315  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  53 
 
 
304 aa  315  8e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  56.57 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  59.34 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  58.97 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  59.34 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  59.34 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  56.12 
 
 
309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  58.24 
 
 
303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  58.24 
 
 
303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  63.14 
 
 
321 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.56 
 
 
329 aa  309  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  51.16 
 
 
305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  58.01 
 
 
349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.16 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.46 
 
 
323 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.46 
 
 
323 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  51.97 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  53.96 
 
 
315 aa  298  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  53.99 
 
 
335 aa  297  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  57.34 
 
 
312 aa  295  7e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  52.19 
 
 
350 aa  294  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.64 
 
 
305 aa  285  5e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  46.67 
 
 
310 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  53.79 
 
 
312 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  48.1 
 
 
310 aa  276  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.64 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.91 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  47.37 
 
 
314 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  45.28 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.18 
 
 
325 aa  272  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  46.28 
 
 
319 aa  272  6e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.64 
 
 
327 aa  271  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.13 
 
 
313 aa  271  9e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
319 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  45.87 
 
 
309 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  45.87 
 
 
309 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  45.87 
 
 
323 aa  267  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  45.54 
 
 
309 aa  266  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  45.21 
 
 
309 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  45.87 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  46.81 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  45.54 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  45.54 
 
 
309 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  46.13 
 
 
305 aa  266  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.19 
 
 
316 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  53.56 
 
 
317 aa  265  5e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  45.54 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  45.54 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  46.45 
 
 
320 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  46.13 
 
 
305 aa  265  7e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  45.67 
 
 
309 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.1 
 
 
306 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.1 
 
 
306 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1288  ATPase  45.39 
 
 
323 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4605  ATPase  48.85 
 
 
323 aa  263  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.18 
 
 
341 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.85 
 
 
314 aa  262  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  46.94 
 
 
372 aa  262  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>