More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0464 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  49.49 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  41.71 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  41.15 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  40.11 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  41.27 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  40.22 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  39.33 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  42.44 
 
 		 194 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  37.16 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  40.7 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  36.46 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  42.77 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 191 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.43 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  35.91 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  43.09 
 
 		 189 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  37.85 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  39.56 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  41.98 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 235 aa  95.5  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 239 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 239 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  36.36 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 		 243 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  30.45 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 243 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 240 aa  87  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.31 
 
 		 249 aa  85.5  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  37.06 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  37.27 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3183  phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  33.53 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0839  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  32.52 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 		 222 aa  77.8  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.6 
 
 		 222 aa  77.8  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  32.03 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  31.66 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  32.16 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  33.85 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  33.33 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  35.9 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 401 aa  72  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  36.26 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  25.25 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.8 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  33.58 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3656  phosphoglycerate mutase family protein  27.8 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  30.48 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  37.01 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  34.32 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.93 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.32 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  32.79 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.74 
 
 		 442 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>