26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0368 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  100 
 
 		 363 aa  737    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  50.16 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  45.1 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  49.67 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  48.34 
 
 		 365 aa  292  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.78 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  48.58 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  48.26 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  49.01 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  46.53 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  47.71 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  42.69 
 
 		 365 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  44.35 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  40.12 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  41.56 
 
 		 342 aa  236  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  41.25 
 
 		 341 aa  232  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  42.22 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  41.85 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  41.85 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  41.56 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  41.85 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  40.94 
 
 		 341 aa  228  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  44.79 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001335  hypothetical protein  28.95 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000552003  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.2 
 
 		 889 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05225  hypothetical protein  28.81 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>