More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0278 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  100 
 
 		 790 aa  1620    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  69.98 
 
 		 647 aa  740    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  46.13 
 
 		 794 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  67.32 
 
 		 710 aa  734    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  80.28 
 
 		 793 aa  1288    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  46.38 
 
 		 793 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  79.16 
 
 		 763 aa  1241    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  63.04 
 
 		 778 aa  975    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  46.71 
 
 		 783 aa  662    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  64.09 
 
 		 608 aa  653    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  45.41 
 
 		 829 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  45.79 
 
 		 787 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  55.42 
 
 		 677 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  64.16 
 
 		 552 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  54.67 
 
 		 725 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.71 
 
 		 680 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  38.62 
 
 		 806 aa  491  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  50 
 
 		 636 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  39.82 
 
 		 676 aa  469  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  39.56 
 
 		 676 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  38.1 
 
 		 777 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  38.58 
 
 		 708 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  36.95 
 
 		 686 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  35.39 
 
 		 728 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  44.85 
 
 		 673 aa  416  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  35.16 
 
 		 725 aa  409  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  43.22 
 
 		 569 aa  406  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  35.24 
 
 		 709 aa  395  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  44.71 
 
 		 580 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.23 
 
 		 676 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  46.48 
 
 		 675 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  39.05 
 
 		 658 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  41.67 
 
 		 659 aa  379  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  42.53 
 
 		 661 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  41.53 
 
 		 670 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  41.32 
 
 		 661 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  41.25 
 
 		 592 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  42.86 
 
 		 661 aa  369  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  42.51 
 
 		 611 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  42.66 
 
 		 655 aa  364  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  35.58 
 
 		 673 aa  362  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  42.38 
 
 		 583 aa  361  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  42 
 
 		 683 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  40.39 
 
 		 589 aa  353  8e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  41.62 
 
 		 607 aa  350  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  42.24 
 
 		 586 aa  351  4e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  39.24 
 
 		 587 aa  339  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.19 
 
 		 663 aa  335  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  38.34 
 
 		 644 aa  322  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  36.76 
 
 		 661 aa  314  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  36.57 
 
 		 659 aa  305  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  36.87 
 
 		 675 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  36.99 
 
 		 799 aa  286  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  37.69 
 
 		 675 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  35.54 
 
 		 691 aa  273  9e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1213  type I restriction-modification system specificity subunit  67.18 
 
 		 196 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  39.74 
 
 		 316 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  50.28 
 
 		 371 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  35.73 
 
 		 697 aa  162  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.74 
 
 		 497 aa  141  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  27.04 
 
 		 498 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  26.58 
 
 		 510 aa  135  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  36.49 
 
 		 496 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  25.41 
 
 		 520 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  25.41 
 
 		 520 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  28.19 
 
 		 574 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  35.44 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  30.91 
 
 		 505 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  28.12 
 
 		 527 aa  129  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  26.68 
 
 		 522 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  27.69 
 
 		 822 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  32.23 
 
 		 518 aa  127  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  32.23 
 
 		 518 aa  127  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  32.23 
 
 		 518 aa  127  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  32.23 
 
 		 518 aa  127  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.34 
 
 		 587 aa  126  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  28.86 
 
 		 508 aa  125  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  28.86 
 
 		 523 aa  125  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1177  XRE family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 519 aa  124  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.602323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  31.62 
 
 		 799 aa  124  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  28.45 
 
 		 504 aa  124  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  28.25 
 
 		 610 aa  124  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  24.79 
 
 		 516 aa  124  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  24.8 
 
 		 511 aa  123  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  25.81 
 
 		 574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  34.02 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  27.6 
 
 		 499 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  26.33 
 
 		 494 aa  122  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  30.81 
 
 		 808 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  32.95 
 
 		 498 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  27.97 
 
 		 540 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  30.12 
 
 		 524 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  27.74 
 
 		 633 aa  121  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  26.68 
 
 		 574 aa  121  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  28.45 
 
 		 499 aa  121  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.71 
 
 		 538 aa  120  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  30 
 
 		 534 aa  120  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  26.58 
 
 		 522 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  27.79 
 
 		 495 aa  120  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  25.6 
 
 		 511 aa  120  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>