29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0210 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  100 
 
 		 89 aa  183  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  57.89 
 
 		 81 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1410  NifZ protein, putative  58.23 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  59.72 
 
 		 77 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  56.58 
 
 		 82 aa  93.6  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  56.58 
 
 		 84 aa  93.6  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  61.43 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  56 
 
 		 83 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  57.14 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  55.56 
 
 		 76 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  58.67 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  55.88 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  56.34 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  48 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  39.44 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  35.62 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  35.62 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  36.62 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  37.68 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  35.62 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  36.62 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  34.72 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  37.5 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1484  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  36.62 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  35.21 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  34.25 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  35.62 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  41.86 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>