More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0186 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0186  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  53.79 
 
 
293 aa  289  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.35 
 
 
299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  52.13 
 
 
304 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  54.01 
 
 
287 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  49.26 
 
 
287 aa  276  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  51.06 
 
 
289 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4522  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.52 
 
 
291 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1326  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.52 
 
 
294 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4398  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  53.52 
 
 
291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.258286 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  54.28 
 
 
273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  54.28 
 
 
273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0540  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.91 
 
 
299 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0476  putative tetrapyrrole methylase  50.91 
 
 
299 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1119  putative tetrapyrrole methylase  50.91 
 
 
299 aa  273  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  48.41 
 
 
286 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  47.99 
 
 
281 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0934  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.82 
 
 
291 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1178  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.98 
 
 
286 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.82 
 
 
280 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3628  tetrapyrrole methylase family protein  49.12 
 
 
286 aa  265  8e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0309  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.55 
 
 
295 aa  265  8.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  48.54 
 
 
282 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.12 
 
 
286 aa  263  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  48.76 
 
 
287 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  48.76 
 
 
286 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.76 
 
 
286 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  50.35 
 
 
281 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  48.76 
 
 
286 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  48.76 
 
 
286 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  54.23 
 
 
287 aa  262  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0315  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.18 
 
 
295 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.656029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  48.41 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.18 
 
 
295 aa  262  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0591  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  51.12 
 
 
272 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4731  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  50.18 
 
 
280 aa  260  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  47.06 
 
 
287 aa  259  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  48.06 
 
 
287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  48.06 
 
 
287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04378  hypothetical protein  52.45 
 
 
265 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445875  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  48.06 
 
 
287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2199  hypothetical protein  51.06 
 
 
286 aa  256  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.26 
 
 
280 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.9 
 
 
280 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3623  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.47 
 
 
292 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.9 
 
 
280 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.9 
 
 
280 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3521  hypothetical protein  47.7 
 
 
287 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  48.53 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4335  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.73 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743179  normal  0.137382 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  45.79 
 
 
288 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  48.53 
 
 
281 aa  252  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methyltransferase  48.16 
 
 
280 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150216  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  47.79 
 
 
281 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4994  hypothetical protein  51.45 
 
 
320 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0353  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.43 
 
 
280 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  51.43 
 
 
282 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  47.25 
 
 
287 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  48.72 
 
 
281 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.16 
 
 
280 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3583  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.12 
 
 
288 aa  248  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.200814 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3452  hypothetical protein  48.41 
 
 
287 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1930  hypothetical protein  50.54 
 
 
285 aa  246  3e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.910019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3144  putative methyltransferase  48.01 
 
 
280 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0122  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.77 
 
 
291 aa  244  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0263  tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methylase family protein  50.18 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2393  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47 
 
 
293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957737  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  44.24 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.35 
 
 
280 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3067  hypothetical protein  47.67 
 
 
283 aa  241  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2281  hypothetical protein  47.69 
 
 
281 aa  240  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.610951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  46.15 
 
 
280 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0404  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.18 
 
 
293 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2101  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.42 
 
 
307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2924  hypothetical protein  48.01 
 
 
283 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  45.59 
 
 
281 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0504  hypothetical protein  49.64 
 
 
279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.48072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5229  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.27 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.291092  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0174  hypothetical protein  47.5 
 
 
292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3420  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.88 
 
 
276 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.798896  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4314  hypothetical protein  48.24 
 
 
292 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0270  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.89 
 
 
295 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0815274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0201  hypothetical protein  47.24 
 
 
296 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3753  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.06 
 
 
282 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0215  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.24 
 
 
296 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405558 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0390  hypothetical protein  47.14 
 
 
279 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0532843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1987  hypothetical protein  42.55 
 
 
285 aa  228  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1143  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.04 
 
 
278 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3464  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.83 
 
 
300 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3390  methyltransferase  48.39 
 
 
293 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3481  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.44 
 
 
276 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000379099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1916  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.55 
 
 
291 aa  226  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0108  hypothetical protein  47.08 
 
 
397 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0368422 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20320  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.55 
 
 
286 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03354  putative methyltransferase  46.18 
 
 
292 aa  225  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0405  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.33 
 
 
304 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3431  hypothetical protein  48.24 
 
 
299 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36467  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2817  hypothetical protein  47.67 
 
 
276 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0289  hypothetical protein  47.67 
 
 
276 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0413  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.98 
 
 
312 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>