More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0168 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0168  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0382909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0062  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0213  ABC transporter related  34.01 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1144  ABC transporter, ATPase subunit  34.02 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176868  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3072  ABC transporter related  35.9 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.78 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.78 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.78 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.78 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.69 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.3 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.33 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  32.69 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  32.69 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.69 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.69 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  32.69 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.69 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.69 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.69 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0895  ABC transporter related  30.1 
 
 		 534 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1042  ABC transporter related protein  37.86 
 
 		 499 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  30.32 
 
 		 455 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2457  ABC transporter related  33.49 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.310276  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02349  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 598 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1107  ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 610 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586381  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21990  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.81 
 
 		 620 aa  102  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  33.04 
 
 		 619 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003428  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  31.96 
 
 		 554 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000488495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  29.28 
 
 		 727 aa  101  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.97 
 
 		 619 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2899  ABC transporter related  32.41 
 
 		 601 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0186152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  32.19 
 
 		 617 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  32.88 
 
 		 590 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  31.82 
 
 		 638 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2375  ABC transporter related  32 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  33.48 
 
 		 596 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_002620  TC0406  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1541  ABC transporter ATP-binding protein  34.65 
 
 		 597 aa  99.8  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  31.42 
 
 		 617 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0534  ABC transporter related protein  29.78 
 
 		 328 aa  99.8  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1701  ABC transporter related  32.43 
 
 		 598 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.02 
 
 		 584 aa  99.8  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4514  ABC transporter related  35.62 
 
 		 600 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  32.58 
 
 		 606 aa  99  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  32 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  29.77 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  29.3 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  32.02 
 
 		 521 aa  99.4  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  32.3 
 
 		 658 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  31.84 
 
 		 244 aa  99  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  32.3 
 
 		 617 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  33.62 
 
 		 610 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07870  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.44 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.995675  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  36.73 
 
 		 246 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.53 
 
 		 738 aa  98.6  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  28.57 
 
 		 552 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  32.74 
 
 		 397 aa  98.6  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1003  ABC transporter related  35.35 
 
 		 565 aa  98.6  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  33.81 
 
 		 233 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  32.44 
 
 		 614 aa  98.2  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  32.16 
 
 		 591 aa  98.2  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  33.94 
 
 		 611 aa  97.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  32.43 
 
 		 661 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  32.16 
 
 		 617 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  34.88 
 
 		 497 aa  97.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.04 
 
 		 610 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  27.95 
 
 		 406 aa  97.1  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02570  ABC transporter, putative  29.68 
 
 		 1216 aa  97.1  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.01 
 
 		 612 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  33.01 
 
 		 612 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.56 
 
 		 606 aa  97.1  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.21 
 
 		 590 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  30.88 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3827  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  32.61 
 
 		 610 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  31.84 
 
 		 622 aa  96.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  31.88 
 
 		 734 aa  96.3  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.32 
 
 		 580 aa  96.3  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  29.36 
 
 		 600 aa  96.3  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.22 
 
 		 736 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0410  putative ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.64 
 
 		 557 aa  96.7  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1492  ABC transporter related  31.67 
 
 		 652 aa  96.3  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.98 
 
 		 582 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  36.1 
 
 		 391 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  34.56 
 
 		 630 aa  96.3  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  28.57 
 
 		 577 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  28.57 
 
 		 577 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  32.84 
 
 		 634 aa  95.9  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  34.23 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1728  ABC transporter related  35.38 
 
 		 277 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  30.91 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  29.2 
 
 		 584 aa  95.9  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1935  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  31.68 
 
 		 606 aa  95.9  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.09 
 
 		 564 aa  95.5  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02200  ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 		 577 aa  95.5  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  32.67 
 
 		 564 aa  95.5  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  27.15 
 
 		 596 aa  95.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3836  ABC transporter related  32.75 
 
 		 610 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  31.98 
 
 		 655 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>